Salmonella và shigella là những ví dụ về nhóm nguy cơ nào?

Lưu ý quan trọng. Bảng dữ liệu an toàn mầm bệnh (PSDS) là tài liệu kỹ thuật được sử dụng bởi những người làm việc với mầm bệnh trong phòng thí nghiệm. Để có được bất kỳ thông tin nào khác về các bệnh truyền nhiễm, vui lòng truy cập Bệnh truyền nhiễm

Bảng dữ liệu an toàn mầm bệnh (PSDS) (trước đây có tiêu đề là Bảng dữ liệu an toàn vật liệu cho các chất truyền nhiễm) là tài liệu kỹ thuật mô tả các đặc tính nguy hiểm của mầm bệnh ở người và đưa ra các khuyến nghị cho công việc liên quan đến các tác nhân này trong môi trường phòng thí nghiệm. Những tài liệu này đã được Cơ quan Y tế Công cộng Canada (PHAC) sản xuất làm nguồn thông tin và giáo dục cho nhân viên phòng thí nghiệm làm việc với các chất truyền nhiễm

Xin lưu ý rằng công việc liên quan đến mầm bệnh ở Canada có thể yêu cầu tuân thủ luật pháp và hướng dẫn quốc tế, quốc gia và cấp tỉnh

Điều khoản sử dụng

Mặc dù thông tin, ý kiến ​​và khuyến nghị có trong mỗi PSDS được tổng hợp từ các nguồn tài liệu được đánh giá ngang hàng được cho là đáng tin cậy, PHAC không chịu trách nhiệm về tính chính xác, đầy đủ hoặc độ tin cậy của PSDS cũng như bất kỳ tổn thất hoặc thiệt hại nào do . Các mối nguy hiểm mới được phát hiện thường xuyên xảy ra và thông tin này có thể không được cập nhật đầy đủ

Cần một PSDS cập nhật hơn?

PHAC thường xuyên xem xét và cập nhật các PSDS được đăng trên trang web; . Nếu bạn yêu cầu phiên bản PSDS mới hơn, chúng tôi khuyên bạn nên thực hiện các cập nhật cần thiết, sử dụng Mẫu PSDS làm hướng dẫn

Không thể tìm thấy PSDS bạn cần?

PHAC sản xuất PSDS như một dịch vụ ưu đãi để cung cấp thông tin về sức khỏe và an toàn về mầm bệnh cho những người làm việc với chúng trong phòng thí nghiệm. Các PSDS hiện được liệt kê là một trong những loại có nhu cầu cao nhất; . Nếu bạn cần một PSDS không có trong danh sách, bạn nên liên hệ với nhà cung cấp tài liệu hoặc bạn có thể phát triển PSDS bằng Mẫu PSDS

Mẫu Bảng dữ liệu an toàn mầm bệnh

Nếu bạn cần một PSDS không có trong danh sách bên dưới, bạn có thể liên hệ với nhà cung cấp tài liệu hoặc tự tạo. Sử dụng mẫu Word có thể chỉnh sửa để tạo PSDS tuân thủ các tiêu chuẩn của Canada. Mẫu Word có thể chỉnh sửa cho phép bạn sử dụng phần mềm tham chiếu của riêng mình

Tải ứng dụng PSDS

Ứng dụng PSDS có sẵn dưới dạng bản tải xuống miễn phí cho các thiết bị của bạn trong các cửa hàng Android, Amazon, Apple và Windows

Nếu bạn nhận thấy lỗi trong PSDS

Chúng tôi hoan nghênh mọi phản hồi về PSDS của chúng tôi. Nếu bạn nhận thấy có lỗi, thiếu thông tin hoặc cần cải thiện, vui lòng cho chúng tôi biết bằng cách gửi email đến Trung tâm An toàn Sinh học. tác nhân gây bệnh. mầm bệnh@phac-aspc. gc. ca

Đại học Stanford tuân theo việc phân loại các tác nhân truyền nhiễm thành các cấp độ như được mô tả trong An toàn sinh học trong Phòng thí nghiệm vi sinh và y sinh (BMBL), ấn bản lần thứ 5, do Trung tâm kiểm soát dịch bệnh (CDC) và NIH biên soạn và xuất bản. Các mô tả về mức độ an toàn sinh học (BSL) 1 – 4 song song với các mô tả trong Hướng dẫn NIH cho nghiên cứu liên quan đến DNA tái tổ hợp. Các loại BSL được chia theo nguy cơ mắc bệnh kết hợp với sự sẵn có của các phương pháp điều trị và phòng ngừa. Bảng bên dưới chứa danh sách đại lý và danh mục của họ. Dấu hoa thị (*) cho biết các tác nhân được chọn

báo trước. Không ai nên kết luận rằng việc không có Tuyên bố tóm tắt tác nhân đối với mầm bệnh ở người có nghĩa là tác nhân đó an toàn để xử lý ở BSL-1 hoặc không có đánh giá rủi ro để xác định mức độ ngăn chặn thích hợp. Người giám sát phòng thí nghiệm cũng nên tiến hành đánh giá rủi ro độc lập trước khi bắt đầu làm việc với một tác nhân hoặc quy trình mới đối với phòng thí nghiệm, ngay cả khi có sẵn bản tóm tắt tác nhân

Những cookie này cho phép chúng tôi đếm số lượt truy cập và nguồn lưu lượng truy cập để chúng tôi có thể đo lường và cải thiện hiệu suất của trang web của mình. Chúng giúp chúng tôi biết trang nào phổ biến nhất và ít phổ biến nhất cũng như xem cách khách truy cập di chuyển quanh trang web. Tất cả thông tin mà các cookie này thu thập được tổng hợp và do đó được ẩn danh. Nếu bạn không cho phép những cookie này, chúng tôi sẽ không biết khi nào bạn đã truy cập trang web của chúng tôi và sẽ không thể theo dõi hiệu suất của nó

Khoa Xét nghiệm Y học, Trung tâm Lâm sàng, Viện Y tế Quốc gia, Bethesda, MD 20892-1508

Thư tín. Karen M. Frank, Khoa Xét nghiệm Y học, Trung tâm Lâm sàng, Viện Y tế Quốc gia, 10 Center Drive MSC 1508, Bethesda, MD 20892-1508, vog. hin@knarf. người mất trí nhớ

thông báo bản quyền

Phiên bản chỉnh sửa cuối cùng của nhà xuất bản của bài viết này có sẵn tại Clin Lab Med

Tóm tắt

Salmonella, Shigella và Yersinia gây ra một loạt bệnh đặc trưng ở người, từ lây truyền không có triệu chứng đến viêm đại tràng xuất huyết và sốt thương hàn gây tử vong. Những mầm bệnh này chịu trách nhiệm cho hàng triệu trường hợp mắc bệnh do thực phẩm ở Hoa Kỳ. S. mỗi năm, với chi phí đáng kể được đo bằng chi phí nhập viện và mất năng suất. Ở các nước đang phát triển, bệnh do các mầm bệnh này gây ra không chỉ phổ biến hơn mà còn có tỷ lệ tử vong cao hơn. Các phương pháp cổ điển để xác định dựa trên môi trường chọn lọc và huyết thanh học, nhưng các phương pháp mới hơn dựa trên khối phổ và PCR cho thấy nhiều hứa hẹn đối với xét nghiệm lâm sàng thông thường

Từ khóa. Salmonella, Shigella, Yersinia, Trực khuẩn đường ruột, Gram âm, viêm dạ dày ruột

Giới thiệu

Trong tổng quan này, chúng tôi thảo luận về ba tác nhân gây bệnh đường ruột. Salmonella, Shigella và Yersinia. Những thành viên quan trọng của Enterobacteriaceae chịu trách nhiệm về tỷ lệ mắc bệnh và tử vong đáng kể, gây tiêu chảy và một loạt các triệu chứng liên quan từ nhẹ đến nặng ở hầu hết các nơi trên thế giới. Trong bài đánh giá này, chúng tôi đề cập đến nhiễm trùng và dịch tễ học, phân loại phân loại, thu thập, vận chuyển và lưu trữ mẫu vật, kỹ thuật nuôi cấy, phương pháp phát hiện phân tử, xét nghiệm độ nhạy cảm và điều trị. Các cuộc thảo luận liên quan đến các sinh vật riêng lẻ được tổ chức thành các phần riêng lẻ bắt đầu với Salmonella, tiếp theo là Shigella, sau đó là Yersinia. Các chủ đề chung cho cả ba (chẳng hạn như thu thập, vận chuyển và lưu trữ mẫu vật và các phương pháp phát hiện đa phân tử) được thảo luận khi chúng xuất hiện lần đầu, được biểu thị như vậy trong các tiêu đề của đoạn văn. Xuyên suốt, ưu tiên thảo luận được đặt vào các kỹ thuật và dữ liệu mới hơn, ít nhấn mạnh hơn vào chi tiết của các phương pháp cổ điển có sẵn trong sách giáo khoa tham khảo

Giới thiệu về vi khuẩn Salmonella

Các thành viên của chi Salmonella gây ra một loạt bệnh đặc trưng ở người, từ thể mang không triệu chứng đến sốt thương hàn gây tử vong. Ở các nước phát triển, viêm dạ dày ruột cấp tính do thực phẩm và viêm ruột kết là những dạng nhiễm khuẩn Salmonella phổ biến nhất, ước tính có khoảng 1. 2 triệu ca nhiễm Salmonellosis không thương hàn hàng năm xảy ra ở Hoa Kỳ. S. – Mặc dù tương đối hiếm ở Mỹ. S. , thương hàn, phó thương hàn và sốt ruột tạo thành một vấn đề sức khỏe cộng đồng toàn cầu rất nghiêm trọng, với 25 triệu ca nhiễm mới và >200.000 ca tử vong xảy ra hàng năm. ,

Salmonella là một thành viên của Enterobacteriaceae, ban đầu được đặc trưng bởi khả năng chuyển hóa citrate như một nguồn carbon duy nhất và lysine như một nguồn nitơ, cũng như khả năng tạo ra hydro sulfua. Tuy nhiên, chỉ riêng xét nghiệm sinh hóa cổ điển không phân biệt rõ ràng các thành viên gây bệnh chính của chi này và phân loại hiện đại thay vào đó dựa vào huyết thanh học và ngày càng dựa vào các phương pháp phân tử

Biểu hiện bệnh do vi khuẩn Salmonella

Nhiễm trùng với Salmonella điển hình theo hai đợt bệnh rất khác nhau, tùy thuộc vào việc chủng Salmonella gây nhiễm là huyết thanh thương hàn hay không thương hàn. Nhiễm trùng huyết thanh không thương hàn thường có biểu hiện tiêu chảy kèm theo sốt và đau quặn bụng 12–72 giờ sau khi nhiễm bệnh. Trong hầu hết các trường hợp ở những người khỏe mạnh, nhiễm trùng này diễn ra tự giới hạn trong 4–7 ngày, nhưng ở những vật chủ nhạy cảm, một số chủng Salmonella không thương hàn nhất định có thể lây lan một cách có hệ thống đến các vị trí khác trong cơ thể. Mặc dù điều này phổ biến hơn ở những người có hệ thống miễn dịch bị tổn thương hoặc các tình trạng bệnh lý tiềm ẩn (e. g. , thiếu máu hồng cầu hình liềm), sự lây lan toàn thân của các chủng Salmonella không thương hàn cũng có thể thấy ở những người khỏe mạnh

Trái ngược với nhiễm khuẩn Salmonella không thương hàn, nhiễm khuẩn thương hàn (chủ yếu là serovar Typhi và Paratyphi) biểu hiện như một bệnh toàn thân, thường nghiêm trọng. Sau khi xâm nhập qua niêm mạc ruột, các chủng thương hàn phát tán qua nhiễm khuẩn huyết sơ cấp thoáng qua có thể xảy ra mà không có tiêu chảy. Sau khi phát tán vào máu, một số cá nhân sẽ bị sốt thương hàn, bao gồm nhiệt độ cao (>39° C), nôn mửa và đau đầu, đôi khi có các biến chứng bao gồm liên quan đến thần kinh, thủng ruột và tử vong

Phân loại theo loài Salmonella

Việc phân loại salmonellae có một lịch sử phức tạp, một phần là do nhiều nhà điều tra độc lập sử dụng các phương pháp kiểu hình, huyết thanh học và kiểu gen để mô tả các mối quan hệ phát sinh gen trong chi và một phần là do những bất đồng về danh pháp. Sự đồng thuận gần đây nhất xác định một sơ đồ phân loại công nhận hai loài chính của Salmonella. S. enterica và S. bongori ( Hình 1 ). Trong sơ đồ này, S. enterica được phân loại thành sáu phân loài. Phân loài I, hoặc S. enterica subsp. ruột; . enterica subsp. xúc xích; . enterica subsp. arizona; . enterica subsp. diarizonae; . enterica subsp. nhà chó; . enterica subsp. indica. – Phân tích trình tự gần đây đã làm sáng tỏ các mối quan hệ di truyền trong chi này và đã hỗ trợ phần lớn cho sơ đồ phân loại trên. , –

Mở trong cửa sổ riêng

Hình 1

Các mối quan hệ trong chi Salmonella, bao gồm các loài, phân loài và chỉ định serovar được minh họa. Lưu ý rằng serovar không có tình trạng phân loại chính thức. Bốn serovar đại diện được hiển thị cho S. enterica subsp. ruột. Chỉ các serovar thương hàn phổ biến nhất và các serovar không gây thương hàn đại diện được hiển thị. Tổng cộng có hơn 2500 serovar, với các serovar gây bệnh phổ biến nhất thuộc về S. enterica subsp. ruột

Bảy thành viên chính của giống Salmonella có thể được phân loại thêm bằng các phương pháp huyết thanh học, dựa trên ba kháng nguyên. O, H và Vi. Sơ đồ gõ huyết thanh xác định >2500 serovar. Độ phân giải được cung cấp bởi các phương pháp đánh máy huyết thanh học đã được chứng minh là có giá trị đối với việc theo dõi dịch tễ học các chủng phân lập trong các đợt bùng phát. Cho rằng S. enterica subsp. enterica chiếm đa số (có tới 99. 5%) các chủng phân lập được nuôi cấy từ người và các động vật máu nóng khác, có lẽ không ngạc nhiên khi phần lớn các serovar gây bệnh thuộc phân loài này. , Ngược lại, S. bongori và các thành viên khác của S. enterica thường được phân lập từ các động vật máu lạnh và các nguồn môi trường, và bệnh Salmonellosis gây ra bởi các serovar đại diện cho các loài khác này là tương đối hiếm, mặc dù nhiễm trùng vẫn xảy ra

Thu thập, Vận chuyển và Bảo quản Mẫu xét nghiệm Phát hiện Salmonella/Shigella/Yersinia

Để chẩn đoán trong phòng thí nghiệm trong các trường hợp bệnh đường tiêu hóa, nên lấy mẫu phân ở giai đoạn đầu của bệnh, lý tưởng nhất là trước khi bắt đầu dùng kháng sinh. , Toàn bộ phân là mẫu được ưu tiên để nuôi cấy và việc kiểm tra nhiều mẫu có thể cải thiện khả năng phục hồi của Salmonella/Shigella/Yersinia. Có thể cần tham khảo ý kiến ​​của phòng thí nghiệm khi các quy tắc từ chối mẫu xét nghiệm không cho phép nuôi cấy nối tiếp. Hầu hết các phương tiện vận chuyển phân có đệm pH được sử dụng phổ biến đều tương thích với việc thu hồi Salmonella/Shigella/Yersina, mặc dù môi trường vận chuyển Cary-Blair được nhiều phòng thí nghiệm ưa thích hơn do tính tương thích của nó với các mầm bệnh phân thông thường khác. ,

Các mẫu phân phải được kiểm tra ngay khi nhận, hoặc được bảo quản ở 4° C nếu đĩa cấy hoặc cấy canh trường sẽ bị trì hoãn hơn 1–2 giờ sau khi lấy. , Tuy nhiên, cần lưu ý rằng việc làm lạnh các mẫu có chứa Shigella trong môi trường vận chuyển không có đệm pH có thể làm giảm khả năng phục hồi trong môi trường nuôi cấy. Trong trường hợp nghi ngờ lây lan toàn thân, như với Salmonella thương hàn, các mẫu cấy từ các nguồn khác (máu, tủy xương, hạch bạch huyết và sinh thiết xương) có thể được gửi nên được thu thập và vận chuyển theo quy trình chuẩn phù hợp với các loại mẫu bệnh phẩm này

Nuôi cấy và phân lập Salmonella

Cấy phân là nguồn phổ biến nhất mà từ đó các huyết thanh không phải thương hàn của Salmonella được phục hồi. Các chủng Salmonella không gây bệnh thương hàn cũng có thể được phục hồi từ máu và mô (hạch bạch huyết, tủy xương, v.v. ) trong trường hợp lây lan toàn thân. Các chủng thương hàn có thể được phân lập dễ dàng hơn từ môi trường nuôi cấy ngoài ruột hơn là từ môi trường phân

Có thể nuôi cấy Salmonella trên nhiều loại môi trường đặc. Thông thường, hai môi trường chọn lọc và vi phân, một trong số đó có tính chọn lọc cao, được cấy vào mẫu phân. Hektoen và thạch xylose-lysine-deoxycholate (XLD) có tính chọn lọc cao và cả hai đều phát hiện ra H2S, tạo điều kiện thuận lợi cho việc xác định các loài Salmonella. Các loại thạch có tính chọn lọc cao hơn, bao gồm cả Salmonella-Shigella, bismuth sulfite và thạch xanh sáng có thể ức chế một số chủng Salmonella sp. , và do đó thường được sử dụng kết hợp với thạch ít chọn lọc hơn. Vì lý do này, môi trường ruột khác biệt ít chọn lọc hơn, chẳng hạn như MacConkey hoặc eosin methylene blue, và môi trường không chọn lọc, chẳng hạn như thạch máu cừu 5% có thể được cấy bổ sung khi một phần của quá trình nuôi cấy phân phát huy tác dụng, tùy thuộc vào sở thích của phòng thí nghiệm. Tuy nhiên, sự phát triển của hệ vi khuẩn phân trên môi trường thạch không chọn lọc có thể che khuất các khuẩn lạc Salmonella hiện diện với số lượng thấp

Phân có thể được cấy vào canh thang làm giàu ngoài các nền văn hóa mạ. Canh thang tăng sinh phục vụ để cho phép sự phát triển của Salmonella trong khi ngăn chặn sự phát triển của hệ thực vật phân bình thường, và do đó có thể cải thiện năng suất thu hồi. Hai canh thang làm giàu thường được sử dụng là canh trường tetrathionate và canh trường selenite. Sau khi phân lập được, Salmonella nên được nuôi cấy lại bằng cách sử dụng các kỹ thuật tiêu chuẩn để thu được các khuẩn lạc để nhận dạng và thử nghiệm tính nhạy cảm (nếu được chỉ định), cũng như để gửi đến phòng thí nghiệm y tế công cộng tại địa phương

Phương pháp xác định vi khuẩn Salmonella

Một khi Salmonella đã được phân lập trong môi trường nuôi cấy, có nhiều phương pháp khác nhau để định danh và phân loại. Xác định chính xác thường dựa trên sự kết hợp của các phương pháp kiểu hình và huyết thanh học. Sơ đồ gõ huyết thanh học Kauffmann-White được sử dụng rộng rãi dựa trên kháng nguyên LPS O, kháng nguyên cờ H1 và H2 và kháng nguyên Vi. Trong khi các kháng nguyên O và H1 có thể được phát hiện ở hầu hết các chủng Salmonella, thì các kháng nguyên H2 chỉ có ở một số chủng nhất định và kháng nguyên Vi được tìm thấy chủ yếu ở các chủng thương hàn. Cần lưu ý rằng Vi, mặc dù hữu ích để phát hiện serovar Typhi, cũng có thể được biểu hiện trong Citrobacter sp. và do đó, kháng nguyên Vi không thể được sử dụng để xác định chính xác

Việc gõ O/H/Vi theo sơ đồ Kauffmann-White tạo ra hơn 2500 serovar, có thể được chỉ định bởi các công thức kháng nguyên được biểu thị bằng quy ước sau. (Các) kháng nguyên O, kháng nguyên Vi nếu có. kháng nguyên H giai đoạn 1. (các) kháng nguyên H giai đoạn 2 nếu có,. Trong sơ đồ Kauffman-White, >1500 serovar từ S. enterica subsp. enterica nhận tên; . enterica và S. bongeri chỉ được gọi bằng công thức. Theo quy ước, tên serovar được viết hoa và không in nghiêng, và không cần thiết phải bao gồm chỉ định phân loài enterica khi đề cập đến serovar, vì chỉ có serovar phân loài enterica được đặt tên. Như vậy cả S. enterica subsp. đường ruột. Viêm ruột và S. đường ruột. Viêm ruột là chỉ định chính xác. Điều quan trọng cần lưu ý là các serovar không có tình trạng phân loại và không nên nhầm lẫn với các loài hoặc phân loài của Salmonella

Như đã trình bày ở trên, phần lớn các serovar được xác định và phần lớn mầm bệnh ở người thuộc về S. enterica subsp. ruột. Một số serovar, chẳng hạn như Typhi và Paratyphi phần lớn bị hạn chế đối với con người. Các serovar khác thường bị giới hạn ở các ổ chứa bệnh lây truyền từ động vật sang người cụ thể và đôi khi chỉ gây nhiễm trùng cho người. Tuy nhiên, nhiễm trùng do các serovar này gây ra có thể nghiêm trọng với sự lây lan toàn thân. Những loài này bao gồm Derby và Choleraesuis (thích nghi với lợn), Saintpaul (thích nghi với gia cầm) và Dublin (thích nghi với bò). Tuy nhiên, các serovar khác, đặc biệt là Typhimurium và Enteritidis dễ dàng di chuyển giữa các ổ chứa ở người và từ động vật sang người, có lẽ chiếm tỷ lệ phổ biến cao của chúng. Dữ liệu Khảo sát của CDC từ năm 2011 cho thấy rằng ba loại serovar được báo cáo phổ biến nhất ở Hoa Kỳ. S. trong thời gian báo cáo là Enteritidis, Typhimurium và Newport. Bệnh nhiễm khuẩn Salmonellosis không thương hàn theo truyền thống có liên quan đến các sản phẩm thịt và gia cầm, nhưng các đợt bùng phát gần đây ngày càng gia tăng do sản phẩm. –

Hiện có một số kỹ thuật để sàng lọc các mẫu ban đầu và môi trường tăng sinh trước khi các khuẩn lạc phân lập sẵn có cho các phương pháp trên. Nuôi cấy canh thang tăng sinh selenite có thể được sàng lọc bởi Wellcolex Color Salmonella (Remel Inc. , Lenexa, KS), một phương pháp dựa trên ngưng kết huyết thanh học. Có những hạn chế quan trọng về độ nhạy và độ đặc hiệu mà người ta phải nhận thức được với bài kiểm tra Wellcolex; . và có thể dẫn đến dương tính giả với xét nghiệm này và không phải tất cả Salmonella sp. được xác định bởi thử nghiệm này

Kiểm tra độ nhạy cảm với kháng sinh đối với Salmonella

Các hướng dẫn hiện tại của CLSI nêu rõ rằng xét nghiệm tính nhạy cảm thông thường được chỉ định đối với các huyết thanh Salmonella thương hàn (Typhi và Paratyphi A-C) từ tất cả các vị trí và đối với các huyết thanh không gây thương hàn từ các vị trí ngoài đường ruột. Các phân lập phân lập nên được kiểm tra tính nhạy cảm với ampicillin, fluoroquinolone và trimethoprim-sulfamethoxazole. Đối với các chủng Salmonella phân lập ngoài đường ruột, cần xét nghiệm thêm cephalosporin thế hệ thứ ba và báo cáo, và chloramphenicol có thể được xét nghiệm và báo cáo nếu được yêu cầu. Cần lưu ý rằng cephalosporin thế hệ 1 và 2, cephamycins và aminoglycosides có thể có hoạt tính in vitro chống lại Salmonella, nhưng không có hiệu quả lâm sàng và không nên được báo cáo là nhạy cảm.

Điểm giới hạn CLSI hiện tại đối với ciprofloxacin và levofloxacin đối với Salmonella thấp hơn so với các Enterobacteriaceae khác. CLSI khuyến nghị rằng các phòng thí nghiệm không thể thực hiện các điểm dừng MIC hiện tại (đã giảm) đối với xét nghiệm fluoroquinolone nên sử dụng axit nalidixic để kiểm tra khả năng giảm tính nhạy cảm với fluoroquinolone. Các chủng đề kháng với axit nalidixic có thể liên quan đến thất bại lâm sàng với fluoroquinolone. Các chủng Salmonella sản xuất ESBL beta-lactamase và NDM-1 loại carbapenemase đã được báo cáo, cũng như S. đường ruột. Typhi phân lập với quần đảo đa kháng thuốc tích hợp nhiễm sắc thể. – Do đó, điều quan trọng đối với phòng xét nghiệm và các bác sĩ lâm sàng là phải nhận thức được khả năng các chủng phân lập kháng đa thuốc và kháng carbapenem

Xác định Salmonella/Shigella/Yersinia bằng Khối phổ

Các phương pháp phân tử, bao gồm khối phổ và bảng ghép kênh dựa trên PCR đã được phát triển để phát hiện vi khuẩn đường ruột và một số phòng thí nghiệm đang bắt đầu kết hợp các kỹ thuật này. Những phương pháp mới hơn này có khả năng cải thiện khả năng cung cấp nhận dạng vi khuẩn nhanh chóng và chính xác của chúng tôi, nhưng chúng có những hạn chế cần hiểu rõ. Ion hóa giải hấp phụ bằng laze có hỗ trợ ma trận thương mại – thiết bị khối phổ thời gian bay (MALDI-TOF MS) có thể giúp xác định nhanh Salmonella và Yersinia, đồng thời xác định hạn chế Shigella. , Cả hai hệ thống Bruker Biotyper và Biomerieux Vitek MS MALDI-TOF MS đều được FDA chấp thuận cho sử dụng chẩn đoán trong ống nghiệm để xác định các chủng Y được nuôi cấy. enterocolitica và Y. pseudotuberculosis (xác định cấp độ loài) và Salmonella (xác định cấp độ chi), nhưng không phải Shigella. Hệ thống Biomerieux Vitek MS có lưu ý của nhà sản xuất rằng nên thử nghiệm xác nhận khi xác định Salmonella được thực hiện. Cả hai hệ thống đều không được FDA phê duyệt để phân loại Salmonella ở cấp độ loài hoặc cấp độ serovar. Tuy nhiên, tài liệu gần đây gợi ý rằng các hệ thống dựa trên khối phổ MALDI-TOF có thể có khả năng phân biệt giữa các phân loài và một số chủng huyết thanh Salmonella. Vì công nghệ này là mới và kinh nghiệm vẫn còn tương đối hạn chế nên cần thận trọng, như được minh họa bằng một báo cáo gần đây về một bệnh nhân bị cả nhiễm khuẩn huyết và các triệu chứng đường tiêu hóa được phân lập vi khuẩn Y. pseudotuberculosis được xác định nhầm là Y. pestis bằng phương pháp MALDI-TOF MS. Điều này nhấn mạnh nhu cầu về cơ sở dữ liệu quang phổ MALDI-TOF MS toàn diện kết hợp với việc xác nhận cẩn thận và thử nghiệm xác nhận bổ sung thích hợp cho nhóm vi khuẩn ít gặp này

Điện di trên gel trường xung (PFGE) đã được sử dụng rộng rãi để định loại dịch tễ học các chủng Salmonella. Gần đây, nhiều phương pháp phân tử đã được phát triển để phân biệt giữa các chủng Salmonella/Shigella/Yersina, bao gồm phương pháp xác định trình tự đa locus và phương pháp dựa trên PCR. – Các phương pháp tiếp cận dựa trên giải trình tự toàn bộ bộ gen cũng đã được sử dụng, được hỗ trợ bởi các bộ gen tham chiếu đã xuất bản. , , –

Phương pháp phân tử dựa trên PCR để phát hiện Salmonella/Shigella/Yersinia

Gần đây, một số bảng nhận dạng mầm bệnh GI ghép kênh dựa trên PCR đã được bán trên thị trường để sử dụng với các mẫu phân ban đầu. Chúng bao gồm hệ thống bioMerieux Biofire Filmarray, hệ thống BD MAX, hệ thống Luminex xTAG, hệ thống Chẩn đoán Savyon và hệ thống Chữ ký Di truyền. Các bảng này cho phép xác định nhanh chóng Salmonella, Shigella và Yersinia từ các mẫu phân ban đầu và cung cấp thời gian quay vòng được cải thiện đáng kể trong chẩn đoán phòng thí nghiệm ban đầu so với các phương pháp dựa trên nuôi cấy. Việc phục hồi các chủng phân lập từ môi trường nuôi cấy vẫn cần thiết để phân loại phân loại và thử nghiệm tính nhạy cảm. Cần lưu ý rằng không có bảng PCR ghép kênh nào có sẵn trên thị trường bao gồm Y. pseudotuberculosis trong danh sách mục tiêu

Mặc dù kinh nghiệm với các bảng điều khiển mới này vẫn còn tương đối hạn chế, một số ấn phẩm gần đây đã bắt đầu làm sáng tỏ hiệu suất của chúng. Wessels và cộng sự. nhận thấy rằng so với các phương pháp chẩn đoán thông thường, bảng điều khiển Luminex xTAG đã báo cáo số lần nhận dạng mầm bệnh gần như gấp đôi. Tuy nhiên, không phải tất cả các kết quả dương tính này đều được xác nhận bằng xét nghiệm PCR độc lập, bao gồm cả một loại vi khuẩn Shigella sp. và bốn loài Salmonella sp. trong tổng số 83 kết quả tích cực được công cụ báo cáo. Do đó, các tác giả khuyến nghị nên thực hiện xét nghiệm khẳng định trước khi báo cáo về vi khuẩn Salmonella bằng phương pháp này. Một nghiên cứu về thuốc thử Luminex xTAG ASR đã chứng minh độ nhạy đối với Salmonella là 92% và đối với Shigella là 93%. Kết luận về độ nhạy của xét nghiệm phát hiện Yersinia sp. bị giới hạn bởi chỉ bao gồm 3 phân lập. Một nghiên cứu so sánh các hệ thống Biofire FilmArray và Luminex xTAG đã chứng minh tỷ lệ dương tính cao hơn với cả hai xét nghiệm so với các phương pháp thông thường; . Hệ thống EasyScreen Chữ ký Di truyền được thử nghiệm ở Úc cho thấy mối tương quan rất tốt về kết quả giữa các phương pháp thông thường và phương pháp phân tử đối với Salmonella, nhưng việc đánh giá hiệu suất để phát hiện Shigella và Yersinia bị hạn chế bởi số lượng nhỏ các chủng phân lập của các chi này được đưa vào nghiên cứu. Việc xác thực đầy đủ các bảng ghép kênh này có thể khá khó khăn do số lượng mầm bệnh phải được kiểm tra và cần phải xác minh tất cả các kết quả dương tính giả được cho là bằng một phương pháp khác có độ nhạy tương đương. Thử nghiệm và kinh nghiệm quan trọng nên được tích lũy trước khi phòng thí nghiệm xem xét thay thế các phương pháp truyền thống bằng một phương pháp phân tử duy nhất

Một cách tiếp cận khác đang được nghiên cứu là phép đo phổ khối ion hóa phun điện PCR (PCR-ESI-MS). Pierce và cộng sự. đã đánh giá xét nghiệm dựa trên PCR-ESI-MS để xét nghiệm mầm bệnh đường ruột trong các mẫu thực phẩm sử dụng mồi oligonucleotide phạm vi rộng nhắm vào các vùng được bảo tồn cao trong bộ gen của sinh vật đích. Salmonella được phát hiện trong các mẫu thử nghiệm bằng phương pháp này với độ nhạy cao, nhưng Shigella chỉ được phát hiện trong 81% trường hợp. Cũng như các phương pháp dựa trên MALDI-TOF MS, các xét nghiệm dựa trên PCR-ESI-MS phụ thuộc rất nhiều vào tính đầy đủ của cơ sở dữ liệu. Trong nghiên cứu này, việc xác định vi khuẩn từ các mẫu thực phẩm yêu cầu sử dụng môi trường tăng sinh chọn lọc và thời gian ủ bổ sung. Công việc tiếp theo là cần thiết để đưa phương pháp này vào sử dụng thường xuyên của các nhà điều tra an toàn thực phẩm

Shigella Dịch tễ học, Biểu hiện Bệnh và Điều trị

Các triệu chứng nhiễm Shigella bao gồm sốt, khó chịu, tiêu chảy ra nước, đau quặn bụng và đau cơ. Thời gian ủ bệnh là 1–4 ngày và bệnh thường khỏi sau 5–7 ngày. Sau 2–3 ngày, số lượng và tần suất tiêu chảy có thể giảm, thay vào đó là máu và chất nhầy trong phân (kiết lỵ), kèm theo tình trạng mót rặn. Một số cá nhân có thể không có triệu chứng, nhưng vẫn có thể truyền vi khuẩn cho người khác. Mặc dù không thường xuyên như bệnh đường tiêu hóa, nhưng có nhiều báo cáo về nhiễm khuẩn huyết và các bệnh nhiễm trùng ngoài đường ruột khác. – Các biến chứng của nhiễm trùng Shigella bao gồm hội chứng tán huyết urê huyết và viêm khớp phản ứng

Tỷ lệ mắc bệnh shigellosis trên toàn thế giới đã được báo cáo là khoảng 165 triệu trường hợp, nhưng tỷ lệ tử vong đã giảm đáng kể trong ba thập kỷ qua. – Mặc dù nguyên nhân của sự giảm tỷ lệ tử vong liên quan đến bệnh shigella này có thể là do nhiều yếu tố, nhưng nó đã xảy ra cùng với sự giảm tỷ lệ nhiễm S. kiết lỵ týp 1. Nhiễm S. dysenteriae týp 1 có tỷ lệ tử vong tương đối cao ở các nước đang phát triển, thể hiện qua tỷ lệ tử vong ca bệnh là 5–15% ở Châu Phi và Trung Mỹ. Ước tính có khoảng 500.000 trường hợp mắc bệnh shigellosis mỗi năm ở Hoa Kỳ. S. với 38 người chết

Các hồ chứa tự nhiên duy nhất được biết đến của Shigella là con người và các loài linh trưởng lớn. Shigellosis có khả năng lây nhiễm cao, với số lượng tối thiểu chỉ 10–100 sinh vật cần thiết để gây bệnh. Dịch bệnh thường xảy ra vào những tháng mùa hè. Lây truyền qua đường phân-miệng, với sự lây lan xảy ra từ người sang người và qua việc tiêu thụ nước hoặc thực phẩm bị ô nhiễm phân từ những người bị nhiễm bệnh. Không có gì đáng ngạc nhiên, bệnh shigella thường thấy hơn trong các điều kiện tạo điều kiện cho vi khuẩn lây lan qua đường phân-miệng, chẳng hạn như ở các trung tâm chăm sóc ban ngày hoặc ở những khu vực không có hệ thống ống nước trong nhà. Các vụ bùng phát cũng đã được mô tả giữa những người trong các cơ sở giam giữ, người Do Thái chính thống, du khách quốc tế và nam giới có quan hệ tình dục với nam giới. – Nhiễm trùng không triệu chứng có liên quan đến sự lây lan của bệnh và kéo dài thời gian bùng phát do lây truyền thầm lặng. Các biểu hiện nghiêm trọng ở ruột và ngoài ruột có thể xảy ra với cả bốn loài Shigella, nhưng phổ biến nhất với S. dysenteriae týp 1, một phần do sản xuất độc tố Shiga. Nhiễm trùng do S. dysenteriae thường mắc phải khi đi du lịch quốc tế và thường kháng nhiều loại thuốc. Shigellosis do S. boydii không phổ biến và chỉ giới hạn ở tiểu lục địa Ấn Độ. S. sonnei là loài đặc hữu ở Hoa Kỳ và các nước phát triển khác. Nhiễm trùng liên quan đến S. sonnei có xu hướng nhẹ hoặc không có triệu chứng

Liệu pháp kháng sinh đã được chứng minh là làm giảm thời gian, sự lây truyền và mức độ nghiêm trọng của các triệu chứng. Quyết định điều trị dựa trên mức độ nghiêm trọng của các triệu chứng và mong muốn giảm sự lây lan, cân bằng với mục tiêu giảm sự phát triển của các chủng kháng thuốc hơn. trong U. S. , bệnh shigellosis có thể được báo cáo cho các phòng thí nghiệm y tế công cộng cấp tiểu bang và tình trạng kháng Shigella được theo dõi bởi Hệ thống giám sát kháng kháng sinh quốc gia đối với vi khuẩn đường ruột, một sự hợp tác của nhiều U. S. cơ quan chính phủ

Nhận dạng phòng thí nghiệm Shigella

Shigella, một thành viên của họ Enterobacteriaceae, được phân thành bốn phân nhóm huyết thanh học. S. dysenteriae (Nhóm A), S. flexneri (Nhóm B), S. boydii (Nhóm C) và S. sonnei (Nhóm D). Mặc dù nhiều tác giả đã coi các phân nhóm Shigella này là các loài phân loại riêng biệt, nhưng Escherichia coli và Shigella rất giống nhau về mặt di truyền (80–90%), và lập luận đã được đưa ra rằng hầu như tất cả các chủng Shigella đều có thể được coi là một kiểu gen của E. coli. S. boydii 13 là ngoại lệ và đã được phân loại lại thành Escherichia albertii. , Do sự giống nhau đáng kể về di truyền của chúng, nên việc phân biệt Shigella với E. coli thường là một thách thức đối với phòng thí nghiệm vi sinh lâm sàng. Tuy nhiên, mặc dù chúng giống nhau về mặt di truyền, các chủng E sinh độc tố Shigella và không phải Shiga. coli thể hiện hành vi lâm sàng khác nhau và sự khác biệt của chúng trong phòng thí nghiệm vi sinh tạo điều kiện thuận lợi cho việc theo dõi dịch tễ học liên tục của chúng như các thực thể riêng biệt

Để tối ưu hóa việc phát hiện Shigella trong phân, các mẫu phải được cấy trên MacConkey và thạch xylose-lysine-deoxycholate, Hektoen enteric hoặc deoxycholate citrate. Các khuẩn lạc có màu xanh hơi xanh trên thạch Hektoen và không có tâm đen như ở Salmonella, vì Shigella không sinh H2S. Shigella không lên men lactose và xyloza và tương đối trơ về mặt sinh hóa. Một số chủng S. sonnei là ngoại lệ và có thể lên men đường sữa. Hầu hết các chủng phân lập không sinh khí, trừ một số S. uốn dẻo. , Các khuẩn lạc thích hợp có thể được đặc trưng thêm bằng cách sử dụng thạch sắt Kligler hoặc thạch sắt ba đường. Các xét nghiệm lysine decarboxylase thường âm tính với Shigella. Các nhóm A, B, C có đặc tính sinh hóa tương tự nhau, nhưng S. sonnei có hoạt tính ornithine decarboxylase và hoạt tính beta-galactosidase

Định loại huyết thanh học nên được thực hiện trên các chủng Shigella. Phân nhóm A (S. dysenteriae) có 17 typ huyết thanh, phân nhóm B (S. flexneri) có 14 týp huyết thanh được chia thành các týp phụ, phân nhóm C (S. boydii) có 19 týp huyết thanh và phân nhóm D (S. sonnei) là một kiểu huyết thanh duy nhất. , Xác nhận nhận dạng và kiểu huyết thanh nên được thực hiện tại phòng thí nghiệm tham chiếu hoặc phòng thí nghiệm y tế công cộng để phân lập từ các bệnh nhiễm trùng ngoài đường ruột hoặc khi phòng thí nghiệm chính không có đầy đủ khả năng xác định kiểu huyết thanh. xâm lấn ruột E. coli là sinh vật trung gian tiến hóa giữa E. coli và Shigella. Một số E xâm lấn ruột. coli (EIEC) có thể phản ứng chéo với kháng huyết thanh Shigella. Cần lưu ý rằng xét nghiệm huyết thanh học đối với huyết thanh của một người bị nhiễm bệnh nói chung không hữu ích cho chẩn đoán

E hoạt động hoặc điển hình. coli có thể được phân biệt với Shigella bằng một số thử nghiệm, bao gồm lysine decarboxylase, khả năng vận động, sinh khí, sử dụng axetat, và quá trình lên men của chất nhầy và đường sữa. Tuy nhiên, các chủng không hoạt động của E. coli có thể có phản ứng trùng lặp với Shigella. chủng không hoạt động của E. coli không di động, kiểu gen gây dị ứng được gọi là kiểu gen Alkalescens-Dispar. Để giải quyết vấn đề này, các phòng thí nghiệm khác nhau đã phát triển các thuật toán khác nhau để xác định E coli và Shigella trong các mẫu phân; . coli từ Shigella khi được phân lập từ các vị trí cơ thể khác

Cho rằng E. coli là chủng phân lập phổ biến hơn nhiều để phục hồi từ hầu hết các môi trường nuôi cấy vô trùng so với Shigella và do nhiều phòng thí nghiệm hạn chế các quy trình phân biệt Shigella với E. coli với mẫu phân, Shigella xuất hiện trong mẫu xét nghiệm ở vị trí vô trùng có thể bị xác định nhầm là E. coli. Điều này đặc biệt có thể xảy ra nếu việc nhận dạng phụ thuộc vào hệ thống tự động, vì các hệ thống thương mại như Vitek 2 có tỷ lệ nhận dạng sai cao. Có một số báo cáo kiểm tra dải API20E để xác định Shigella, với các báo cáo khác nhau về độ chính xác. – Nếu một Shigella phân lập từ một vị trí ngoài ruột được xác định nhầm là E. coli, tính nhạy cảm phản xạ được thực hiện và báo cáo sẽ phù hợp với E. coli phân lập. Tuy nhiên, các hướng dẫn CLSI khác nhau đối với hai sinh vật, với cephalosporin thế hệ thứ nhất và thứ hai, cephamycins và aminoglycosides được loại trừ khỏi xét nghiệm các chủng Shigella, do tính nhạy cảm giả trong ống nghiệm của tôi xảy ra. Kết quả là, một Shigella được xác định nhầm từ một vị trí như máu, có thể được điều trị nhầm bằng một tác nhân không hiệu quả (e. g. aminoglycoside), với khả năng thất bại lâm sàng. Hơn nữa, một trường hợp như vậy có thể bị bỏ sót trong quá trình theo dõi tỷ lệ nhiễm Shigella, trừ khi Shigella được phân lập từ mẫu phân đồng thời. Thuật toán phân biệt E. coli và Shigella được trình bày trong Hình 2 .

Mở trong cửa sổ riêng

Hình 2

Chìa khóa để phân biệt Shigella, Escherichia coli xâm lấn ruột (EIEC) và Escherichia coli không xâm lấn. (Từ van den Beld MJ, Reubsaet FA. Phân biệt giữa Shigella, Escherichia coli xâm lấn ruột (EIEC) và Escherichia coli không xâm lấn. Tạp chí châu Âu về vi sinh lâm sàng & bệnh truyền nhiễm. ấn phẩm chính thức của Hiệp hội Vi sinh lâm sàng Châu Âu 2012;31(6). 899–904;

1. Dựa trên xác định Enterobacteriaceae của Edwards và Ewing, ấn bản lần thứ 4, năm 1986 và/hoặc hướng dẫn xác định vi khuẩn y tế của Cowan và Steel, ấn bản thứ 3, 1993

2. Được thực hiện với quy trình PCR tiêu chuẩn, với các đoạn mồi được thiết kế để khuếch đại một phần vùng ipaH7 được bảo tồn. 8, theo mô tả của Buysse et al. , vi khuẩn. mầm bệnh. 19(5). 335–349

3. Ủ trong 24 giờ trong môi trường BHI ở 37°C

4. Được biết O. Các kiểu huyết thanh H của EIEC theo Bergey’s manual of Systematic Bacteriology, 2nd edition, volume 2, The Proteobacteria, Part B The Gammaproteobacteria

Do khó khăn lâu nay trong việc phân biệt Shigella với E. coli, một số phương pháp mới hơn đã được đánh giá. Khot và Fisher đã ứng dụng phần mềm ClinProTools của Bruker Daltonics để phát triển và thuật toán phân biệt Shigella với E. coli sử dụng khối phổ MALDI-TOF. Tỷ lệ xác định sai 3% mà các tác giả này đạt được tốt hơn so với tỷ lệ được thấy với các dụng cụ sinh hóa tự động. Tuy nhiên, với tỷ lệ lỗi vẫn còn đáng kể, cách tiếp cận như vậy không làm mất đi sự cần thiết của các phương pháp sinh hóa truyền thống

Các hướng dẫn đã được viết để kiểm tra tất cả phân của tất cả bệnh nhân bị tiêu chảy cấp tính mắc phải tại cộng đồng để tìm vi khuẩn E sản sinh độc tố Shiga. coli, bởi vì các chiến lược xét nghiệm chọn lọc như chỉ xét nghiệm phân có máu, hoặc phân của trẻ em, hoặc trong các tháng mùa hè, không phát hiện được tất cả các mẫu dương tính. Do tỷ lệ lưu hành thấp nên không phải bệnh viện nào cũng chọn xét nghiệm tất cả các mẫu phân như vậy. Độc tố Shiga do S. dysenteriae týp 1 rất giống với độc tố Shiga 1 do một số E gây xuất huyết ruột. coli, vì vậy một số xét nghiệm nhanh có thể phát hiện độc tố từ E. coli hoặc loài Shigella cụ thể này. – Shigella không sản xuất độc tố không nên được phát hiện bằng các xét nghiệm đó. Cần lưu ý rằng các gen mã hóa độc tố Shiga có thể được phát hiện ở những người tình nguyện khỏe mạnh bằng phương pháp PCR mẫu phân, vì vậy mối tương quan với các triệu chứng lâm sàng và nuôi cấy phân lập là rất cần thiết để chẩn đoán khi sử dụng loại xét nghiệm phân tử này

Kiểm tra độ nhạy cảm với Shigella

Shigella solate nên được thử nghiệm với ampicillin, fluoroquinolone và trimethoprim-sulfamethoxazole. Có sự đề kháng đáng kể với ampicillin và trimethoprim-sulfamethoxazole. , Ở châu Á, đã có báo cáo về tình trạng kháng ciprofloxacin, pivmecillinam và azithromycin, với một số kháng mới nổi lên đối với cepholosporin thế hệ thứ ba và các loại thuốc bổ sung. – Một báo cáo gần đây từ các nghiên cứu ở Bangladesh cho thấy sự gia tăng khả năng kháng ciprofloxacin từ 0% năm 2004 lên 44% vào năm 2010

Cơ chế độc lực của Shigella

Cơ chế bệnh sinh của Shigella liên quan đến sự di chuyển qua các tế bào M ở hồi tràng và đại tràng, được các đại thực bào hấp thu, xâm lấn vào đáy tế bào biểu mô và phát tán trong niêm mạc. , Shigella có một plasmid độc lực lớn, mã hóa hệ thống bài tiết loại III và một tập hợp các protein được tiết ra. Hệ thống dẫn đến việc tiêm các yếu tố độc lực vào các tế bào biểu mô đại tràng của vật chủ, dẫn đến tổn thương lớp biểu mô, cũng như các protein đối kháng với phản ứng miễn dịch thích ứng và bẩm sinh. , độc lực Shigella được tăng cường bởi sự hiện diện của enterotoxin, độc tố này tách biệt với độc tố Shiga được tạo ra trong các chủng hạn chế. Các gen mã hóa các gen độc tố Shiga nằm trong bộ gen của các tiên tri lambdoid không đồng nhất. Đây là những yếu tố di truyền có tính di động cao, có vai trò chuyển gen ngang và đa dạng hóa hệ gen. Độc tố Shiga được tạo ra bởi các chủng Shigella dysenteriae loại I và E. coli O157. H7 trong số các E khác. các chủng sinh độc tố coli shiga. Độc tố giống Shiga II, cũng được tìm thấy ở một số E. coli tương đồng 56% với độc tố Shiga (hoặc độc tố giống Shiga I)

vắc-xin Shigella

Tỷ lệ mắc bệnh shigellosis giảm dần theo tuổi tác ngày càng tăng cho thấy khả năng miễn dịch tự nhiên phát triển, ngụ ý rằng vắc-xin tạo ra phản ứng tự nhiên này có thể có hiệu quả. Hiện tại không có vắc-xin Shigella được cấp phép, nhưng có nhiều loại vắc-xin đang ở giai đoạn tiền lâm sàng hoặc thử nghiệm lâm sàng, bao gồm vắc-xin sống giảm độc lực, giết chết toàn tế bào, liên hợp và vắc-xin tiểu đơn vị. Vắc xin đã được thiết kế để chống lại các kháng nguyên O và vắc xin liên hợp cũng đã được phát triển bằng cách sử dụng một số phân tử kháng nguyên được bảo tồn khác nhau. Dữ liệu bị hạn chế về thông số miễn dịch tương quan với khả năng miễn dịch bảo vệ. Cần nhiều nghiên cứu hơn trước khi chúng ta biết liệu vắc-xin Shigella có hiệu quả hay không

Yersinia Dịch tễ học và biểu hiện bệnh

Yersinia là tác nhân gây bệnh từ động vật phân bố trên toàn thế giới và có cả chủng gây bệnh và không gây bệnh. Các loài Yersinia liên quan đến bệnh ở người bao gồm Y. giả lao, Y. enterocolitica và Y. dịch hại. Trong số các loài có ý nghĩa lâm sàng này, chúng ta sẽ chỉ thảo luận về Y. enterocolitica và Y. pseudotuberculosis, vì tổng quan này tập trung vào mầm bệnh đường ruột. Bệnh do Y. enterocolitica biểu hiện như viêm hồi tràng giai đoạn cuối, viêm hạch bạch huyết và viêm ruột cấp tính do ăn phải thức ăn hoặc nước bị ô nhiễm. Các triệu chứng thường phát triển sau 4–7 ngày sau khi tiếp xúc và có thể kéo dài 1–3 tuần. Các biến chứng bao gồm phát ban da, đau khớp và nhiễm khuẩn huyết. Đau bụng bên phải trong một số trường hợp Y. nhiễm trùng enterocolitica có thể bị nhầm lẫn với viêm ruột thừa. Bệnh có thể bao gồm ban đỏ nốt, viêm đa khớp và ít phổ biến hơn là nhiễm trùng máu hoặc viêm nội tâm mạc. – Viêm khớp phản ứng là một biến chứng không phổ biến, nhưng có thể gặp đặc biệt ở những bệnh nhân suy giảm miễn dịch và những người có alen HLA-B27. Các rối loạn liên quan cũng bao gồm bệnh viêm ruột và rối loạn tuyến giáp tự miễn. Tình trạng quá tải sắt do các tình trạng cơ bản, chẳng hạn như bệnh hemochromatosis di truyền hoặc beta thalassemia, hoặc điều trị bằng deferoxamine, dẫn đến tăng khả năng mắc các biểu hiện nhiễm trùng máu. ,

nhiễm trùng Y. enterocolitica phổ biến hơn trong những tháng mùa đông và thường thấy ở trẻ nhỏ. Có một trường hợp Y được xác nhận bằng văn hóa. enterocolitica trên 100.000 cá nhân mỗi năm tại Hoa Kỳ. CDC theo dõi bệnh do thực phẩm với mạng lưới giám sát, FoodNet. Nguồn lây nhiễm có thể bao gồm thịt nguội đóng gói sẵn bị ô nhiễm, thịt lợn chưa nấu chín, sữa chưa tiệt trùng hoặc nước chưa được xử lý. Chuẩn bị chitterlings (ruột già lợn), một món ăn cho bữa ăn ngày lễ, có liên quan đến nhiều trường hợp nhiễm trùng ở trẻ sơ sinh, do người chăm sóc xử lý thực phẩm bị ô nhiễm– Sinh vật này có thể nhân lên ở nhiệt độ lạnh, góp phần vào vai trò của nó

Y. pseudotuberculosis là bệnh lưu hành ở nhiều loại động vật, bao gồm cả gia cầm. Y. pseudotuberculosis thường tạo ra một bệnh tự giới hạn. Nhiễm trùng có thể biểu hiện như viêm hạch mạc treo, và cũng có thể bị nhầm lẫn với viêm ruột thừa. Bệnh nhiễm trùng huyết hiếm gặp và nếu được phát hiện, rất có thể sẽ xảy ra ở người mắc các rối loạn tiềm ẩn làm tăng khả năng nhiễm trùng nặng. – Y. pseudotuberculosis đã được báo cáo là tác nhân gây bệnh từ thực phẩm. ,

Nhận dạng Phòng thí nghiệm Yersinia

Yersinia là trực khuẩn gram âm thuộc họ Enterobacteriacae. Có 11 loài Yersina, nhưng chỉ có ba loài rõ ràng là mầm bệnh ở người. Trình tự bộ gen tiết lộ rằng Y. dịch hại và Y. pseudotuberculosis có liên quan chặt chẽ, nhưng khác biệt đáng kể so với Y. đau ruột. Yersinia có thể xuất hiện nhỏ và coccobacillary trong phết nhuộm Gram. Nó thể hiện sự nhuộm lưỡng cực được mô tả như một hình dạng chốt an toàn trên nhuộm Giemsa. Yersinia phát triển trên môi trường thạch máu, sô cô la và MacConkey, nhưng có thể bị các sinh vật khác phát triển quá mức do tốc độ tăng trưởng chậm. Yersinia có thể hình thành khuẩn lạc xác định trên cả thạch máu và thạch MacConkey trong 24 giờ, đặc biệt là Y. giả lao. Yersinia dương tính với catalase, oxidase âm tính và lên men glucose. Các loài Yersinia có kiểu kiềm trên axit trên Kligler Iron Agar và không di động ở 36°C, nhưng di động ở 22°C. Tăng trưởng tối ưu được quan sát thấy ở 25–32°C. Ủ lâu hơn cho thấy các khuẩn lạc lồi màu trắng xám, 1–2 mm. Y. enterocolitica xuất hiện dưới dạng khuẩn lạc nhỏ, âm tính với đường sữa trên MacConkey sau 48 giờ. Môi trường chọn lọc, chẳng hạn như cefsulodin-irgasan-novobiocin (CIN) và ủ ở nhiệt độ thấp hơn có thể tăng cường khả năng phát hiện. Các khuẩn lạc xuất hiện dạng hồng tâm với tâm màu đỏ trên thạch CIN, mặc dù một số vi khuẩn khác cũng sẽ có dạng này. Sử dụng thạch xanh metylen eosin và thạch sắt ba đường có thể không dẫn đến sự khác biệt rõ ràng với các coliform khác. Y. enterocolitica được ủ ở nhiệt độ phòng sẽ hoạt động sinh hóa nhiều hơn và có thể nhận dạng tốt hơn ở nhiệt độ này với một số hệ thống như API 20E, vì các hệ thống thương mại như Vitek có thể không xác định được các sinh vật này trong điều kiện thông thường. ,

Y. pseudotuberculosis là trực khuẩn gram âm đa hình thái có thể phát triển ở nhiệt độ từ 4°C đến 43°C, với nhiệt độ tối ưu trong khoảng 25–28°C. Các loài Yersinia trong ruột có thể được phân biệt về mặt sinh hóa; . enterocolitica và âm tính với Y. giả lao. Xét nghiệm hấp thụ miễn dịch liên kết với enzyme và xét nghiệm dòng chảy bên tồn tại, nhưng không được sử dụng phổ biến cho các phòng thí nghiệm thông thường, thay vào đó được sử dụng chủ yếu trong nghiên cứu

Nhóm huyết thanh Yersinia

Trong số 6 biovar của Y. enterocolitica (1A, 1B, 2, 3, 4), , five gây bệnh cho người. Người ta đã đề xuất rằng các chủng biotype 1A có thể đại diện cho một nhóm mầm bệnh mới nổi tiềm năng. Chúng có thể được xác định trong các mẫu bệnh phẩm, nhưng mối liên hệ rõ ràng với bệnh ở người chưa được thiết lập. Huyết thanh học đã được sử dụng trong điều tra các bệnh nhiễm trùng dịch hạch do Y. pestis, trong trường hợp một sinh vật không được phục hồi trong môi trường nuôi cấy. Tuy nhiên, huyết thanh học của Y. enterocolitica và Y. pseudotuberculosis phần nào bị hạn chế bởi các phản ứng chéo do nhiễm trùng với các loài vi khuẩn khác và do con người tiếp xúc với các loài Yersinia không gây bệnh

Độc lực của Yersinia

Một yếu tố độc lực của Yersinia là yersiniabactin, một hệ thống hấp thu sắt siderophore có trong Yersinia độc lực, bao gồm Y. dịch hại, Y. giả lao và Y. enterocolitica biotype 1B. Các gen liên quan đến sinh tổng hợp, vận chuyển và điều hòa yeriniabactin nằm trên một yếu tố di truyền di động, đảo có khả năng gây bệnh cao. Yếu tố di động này đã góp phần vào sự phát tán ngang của các gen yersiniabactin vào các Enterobacteriacae khác. Ngoài ra, các loài Yersina chứa các hệ thống nhặt sắt siderophore thay thế, với một số chủng chứa cả ba hệ thống, yersiniabactin, pseudochelin và yersiniachelin.

Y. pseudotuberculosis có một plasmid độc lực, pYV, mang hệ thống bài tiết loại III tạo thành cấu trúc kim trên bề mặt vi khuẩn để tiêm các protein màng ngoài Yersinia (Yops) vào tế bào chủ đích. Hệ thống này dẫn đến sự gián đoạn của cả đáp ứng miễn dịch bẩm sinh và thích nghi, ức chế quá trình thực bào

Kiểm tra độ nhạy cảm của Yersinia

một số Y. enterocolitica có beta lactamase mã hóa nhiễm sắc thể, tạo ra khả năng kháng ampicillin, cephalothin và carbenicillin. Điều trị Y. enterocolitica có thể bao gồm aminoglycoside, doxycycline, trimethoprim-sulfamethoxazole, cephalosporin thế hệ thứ ba hoặc fluoroquinolone. Có sự đề kháng đáng kể với fluoroquinolones ở một số vùng, do đột biến gen gyr A và cơ chế dòng chảy. Y. nhiễm trùng pseudotuberculosis thường không cần điều trị, nhưng nhiễm khuẩn huyết có thể được điều trị bằng ampicillin, tetracycline hoặc streptomycin. Vi khuẩn này thường nhạy cảm với cephalosporin phổ rộng, aminoglycoside, chloramphenicol, tetracycline và trimethoprim-sulfamethoxazole

Bệnh mãn tính liên quan đến nhiễm trùng Salmonella/Shigella/Yersinia

Một cuộc kiểm tra các trường hợp viêm dạ dày ruột do Salmonella, Campylobacter, Shigella hoặc Yersinia ở quân nhân Hoa Kỳ dẫn đến một báo cáo về tỷ lệ di chứng sức khỏe mãn tính cao hơn một số báo cáo trước đó. Sự gia tăng đặc hiệu của mầm bệnh được quan sát thấy có liên quan đến việc tăng nguy cơ mắc bệnh ruột kích thích, khó tiêu, táo bón và bệnh trào ngược dạ dày thực quản, với nguy cơ tương đối là 13. 1 cho bệnh viêm ruột sau nhiễm Yersinia. Ba phân tích tổng hợp riêng biệt đã cho thấy nguy cơ mắc hội chứng ruột kích thích tăng đáng kể sau viêm dạ dày ruột do Shigella. –

​

Những điểm chính

• Gánh nặng bệnh tật toàn cầu do Salmonella/Shigella/Yersinia, những sinh vật phải báo cáo cho các sở y tế công cộng, là khá cao, với số ca nhiễm đáng kể nhưng ít hơn ở các nước phát triển

• Mặc dù có nhiều loại bệnh liên quan đến các mầm bệnh này, nhưng nhiễm trùng tự giới hạn trong phần lớn các trường hợp. Điều trị bằng kháng sinh thường chỉ được chỉ định cho bệnh đường tiêu hóa và hệ thống nghiêm trọng

• chủng không hoạt động của E. coli có thể khó phân biệt với các chủng Shigella, sử dụng nhiều phương pháp phòng thí nghiệm

• Các phương pháp phân tử như PCR và khối phổ đang được sử dụng thường xuyên hơn để xác định các sinh vật này, nhưng cả hai phương pháp đều có những hạn chế

• Có điều tra tích cực trong các lĩnh vực phát triển vắc-xin và đặc tính của các cơ chế độc lực

hộp 1

Phòng chống nhiễm trùng Yersinia

• Tránh thịt lợn sống hoặc nấu chưa chín

• Tránh sữa và các sản phẩm sữa chưa tiệt trùng

• Rửa tay bằng xà phòng và nước trước khi chuẩn bị thức ăn hoặc ăn uống, và sau khi tiếp xúc với động vật hoặc thịt sống

• Tránh tiếp xúc với trẻ nhỏ khi chế biến rươi sống

• Làm sạch tất cả các bảng bếp và đồ dùng sau khi chuẩn bị thịt sống

• Xử lý phân động vật một cách hợp vệ sinh

(Từ Yersinia. Trung tâm quốc gia về các bệnh truyền nhiễm mới nổi và lây từ động vật sang người. Trung tâm Kiểm soát và Phòng ngừa Dịch bệnh (CDC). Có sẵn tại. http. //www. CDC. gov/nczved/divisions/dfbmd/diseases/yersinia/)

hộp 2

Rào cản đối với sự phát triển của vắc-xin Shigella

• Chúng ta hiểu biết hạn chế về khả năng miễn dịch bảo vệ đối với Shigella

• Có bất kỳ loại huyết thanh nào của Shigella

• Thiếu mô hình động vật phù hợp

• Mối quan tâm về việc sản xuất viêm khớp phản ứng ở những người nhận thử nghiệm vắc-xin

• Mối quan tâm về tác dụng phụ đường tiêu hóa hoặc tình trạng mãn tính

• Thách thức trong quá trình sản xuất

• Một số thúc đẩy tài trợ cho nước sạch và vệ sinh thay vì nghiên cứu vắc-xin

Từ Barry EM, Pasetti MF, Sztein MB, et al. Tiến bộ và cạm bẫy trong nghiên cứu vắc-xin Shigella. Đánh giá tự nhiên Khoa Tiêu hóa & Gan mật 2013;10(4). 245–255;

TỰ ĐÁNH GIÁ

1. Phát biểu nào sau đây là đúng khi nói về vi khuẩn Salmonella?

   1. S. bongeri là một nguyên nhân phổ biến của bệnh Salmonellosis ở người

   2. Bệnh sốt phát ban gây ra bởi một serovar của S. enterica subsp. Ấn Độ

   3. Các serovar của Salmonella có tình trạng phân loại chính thức tương tự như phân loài Salmonella đã đặt tên

   4. Các chủng Salmonella thương hàn có khả năng gây bệnh toàn thân cao hơn các chủng không thương hàn

   5. Các sản phẩm sữa chưa tiệt trùng là nguồn lây nhiễm Salmonella phổ biến nhất ở người tại Hoa Kỳ. S

2. Phát biểu nào sau đây đúng về Shigella?

   1. Tiêu chảy do nhiễm Shigella hầu như luôn có máu

   2. Tất cả bệnh nhân nhiễm Shigella cần được dùng kháng sinh kịp thời để tránh di chứng

   3. Khuẩn lạc có tâm màu đen trên thạch Hektoen là đặc trưng của Shigella

   4. Hai trong số bốn nhóm loài Shigella thường mang gen độc tố shiga

   5. chủng không hoạt động của E. coli rất khó phân biệt với Shigella với nhiều hệ thống nhận dạng trong phòng thí nghiệm

3. Phát biểu nào sau đây đúng về Yersinia?

   1. Y. dịch hại, Y. enterocolitica và Y. pseudotuberculosis đều có bộ gen giống nhau

   2. Bệnh nhân Y thường gặp. enterocolitica bị nhiễm khuẩn huyết như một biến chứng

   3. Hiện tại không có vai trò nào đối với MALDI-TOF MS trong việc xác định Yersinia do hoạt động kém trong các nghiên cứu đã công bố

   4. Có nhiều báo cáo về các bệnh mãn tính đường tiêu hóa là di chứng của nhiễm trùng Yersinia

   5. Có 50 týp huyết thanh của Yersinia được biết là gây bệnh ở người

Đáp án cho câu hỏi trắc nghiệm

1. D

2. E

3. D

chú thích

Tuyên bố từ chối trách nhiệm của nhà xuất bản. Đây là tệp PDF của một bản thảo chưa được chỉnh sửa đã được chấp nhận để xuất bản. Là một dịch vụ cho khách hàng của chúng tôi, chúng tôi đang cung cấp phiên bản đầu tiên của bản thảo. Bản thảo sẽ trải qua quá trình sao chép, sắp chữ và xem xét bằng chứng thu được trước khi nó được xuất bản ở dạng có thể trích dẫn cuối cùng. Xin lưu ý rằng trong quá trình sản xuất có thể phát hiện ra các lỗi có thể ảnh hưởng đến nội dung và tất cả các tuyên bố từ chối trách nhiệm pháp lý áp dụng cho tạp chí đều có liên quan

Người giới thiệu

1. Patrick ME, Adcock PM, Gomez TM, và những người khác. Nhiễm khuẩn Salmonella enteritidis, Hoa Kỳ, 1985–1999. Bệnh truyền nhiễm mới nổi. 2004; 10 (1). 1–7. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

2. Braden CR. Salmonella enterica serotype Enteritidis và trứng. một dịch bệnh quốc gia ở Hoa Kỳ. Bệnh truyền nhiễm lâm sàng. một ấn phẩm chính thức của Hiệp hội bệnh truyền nhiễm Hoa Kỳ. 2006; 43 (4). 512–517. [PubMed] [Google Scholar]

3. Hanning IB, Nutt JD, Ricke SC. Dịch bệnh Salmonellosis bùng phát ở Mỹ do đồ tươi sống. nguồn và các biện pháp can thiệp tiềm năng. Mầm bệnh và mầm bệnh từ thực phẩm. 2009; 6 (6). 635–648. [PubMed] [Google Scholar]

4. Holt KE, Thomson NR, Wain J, và cộng sự. Sự tích lũy pseudogene trong lịch sử tiến hóa của các serovar Salmonella enterica Paratyphi A và Typhi. Bộ gen BMC. 2009; 10 . 36. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

5. Dougan G, Baker S. Salmonella enterica serovar Typhi và cơ chế bệnh sinh của bệnh thương hàn. Đánh giá hàng năm về vi sinh. 2014; 68 . 317–336. [PubMed] [Google Scholar]

6. Nataro JP, Bopp CA, Fields PI, Kaper JB, Strockbine NA, Escherichia, Shigella, Salmonella. Trong. Sổ tay vi sinh lâm sàng. tái bản lần thứ 10. Versalovic J, Carroll KC, Funke G, Jorgensen JH, Landry ML, Warnock DW, biên tập viên. tập. 1. Hoa Thịnh Đốn. C. Báo chí ASM; . trang. 603–626. [Google Scholar]

7. www. CDC. gov/salmonella/General/

8. Le Minor LaP M. Ký hiệu của Salmonella enterica sp. tháng mười một. , nôm. vòng quay. , là Loại và Loài duy nhất của Chi Salmonella. Tạp chí quốc tế về vi khuẩn học có hệ thống. 1987; 37 (4). 465–468. [Google Scholar]

9. Euzeby JP. Sửa đổi danh pháp Salmonella. ký hiệu của Salmonella enterica (cũ Kauffmann và Edwards 1952) Le Minor và Popoff 1987 sp. tháng mười một. , nôm. vòng quay. là loài mới của chi Salmonella Lignieres 1900 (danh sách được phê duyệt năm 1980), bác bỏ tên gọi Salmonella choleraesuis (Smith 1894) Weldin 1927 (danh sách được phê duyệt năm 1980), và bảo tồn tên gọi Salmonella typhi (Schroeter 1886) Warren và Scott 1930 ( . Tạp chí quốc tế về vi khuẩn học có hệ thống. Request for an opinion. International journal of systematic bacteriology. 1999; 49 (Pt 2). 927–930. [PubMed] [Google Scholar]

10. Tindall BJ, Grimont PA, Garrity GM, v.v. Danh pháp và phân loại của chi Salmonella. Tạp chí quốc tế về vi sinh học có hệ thống và tiến hóa. 2005; 55 (Pt 1). 521–524. [PubMed] [Google Scholar]

11. Reeves MW, Evins GM, Heiba ​​AA, v.v. Bản chất dòng vô tính của Salmonella typhi và mối liên hệ di truyền của nó với các loài salmonellae khác như được thể hiện bằng điện di enzyme đa điểm và đề xuất về lược Salmonella bongori. tháng mười một. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 1989; 27 (2). 313–320. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

12. Edward RA, Olsen GJ, Maloy SR. Bộ gen so sánh của salmonellae liên quan chặt chẽ. Xu hướng vi sinh học. 2002; 10 (2). 94–99. [PubMed] [Google Scholar]

13. McClelland M, Sanderson KE, Spieth J, và những người khác. Trình tự bộ gen hoàn chỉnh của huyết thanh Salmonella enterica Typhimurium LT2. Thiên nhiên. 2001; 413 (6858). 852–856. [PubMed] [Google Scholar]

14. Parkhill J, Dougan G, James KD và cộng sự. Trình tự bộ gen hoàn chỉnh của huyết thanh Salmonella enterica đa kháng thuốc Typhi CT18. Thiên nhiên. 2001; 413 (6858). 848–852. [PubMed] [Google Scholar]

15. Porwolik S, McClelland M. Chuyển gen bên trong Salmonella. Vi khuẩn và nhiễm trùng / Viện Pasteur. 2003; 5 (11). 977–989. [PubMed] [Google Scholar]

16. Chiu CH, Tang P, Chu C, et al. Trình tự bộ gen của Salmonella enterica serovar Choleraesuis, một tác nhân gây bệnh lây truyền từ động vật sang người có khả năng kháng và xâm lấn cao. Nghiên cứu axit nucleic. 2005; 33 (5). 1690–1698. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

17. Baker S, Dougan G. Bộ gen của Salmonella enterica serovar Typhi. Bệnh truyền nhiễm lâm sàng. một ấn phẩm chính thức của Hiệp hội bệnh truyền nhiễm Hoa Kỳ. 2007; 45 (Bổ sung 1). S29–S33. [PubMed] [Google Scholar]

18. Litrup E, Torpdahl M, Malorny B, và cộng sự. Mối liên quan giữa phát sinh loài, tiềm năng độc lực và các serovar của Salmonella enterica. Lây nhiễm, di truyền và tiến hóa. tạp chí dịch tễ học phân tử và di truyền tiến hóa trong các bệnh truyền nhiễm. 2010; 10 (7). 1132–1139. [PubMed] [Google Scholar]

19. Lan R, Reeves PR, Octavia S. Cấu trúc dân số, nguồn gốc và sự tiến hóa của các dòng vô tính Salmonella enterica chính. Lây nhiễm, di truyền và tiến hóa. tạp chí dịch tễ học phân tử và di truyền tiến hóa trong các bệnh truyền nhiễm. 2009; 9 (5). 996–1005. [PubMed] [Google Scholar]

20. Jacobsen A, Hendriksen RS, Aaresturp FM, và những người khác. Bộ gen Salmonella enterica. Sinh thái vi sinh vật. 2011; 62 (3). 487–504. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

21. Grimont PADaW F. Công thức kháng nguyên của các Serovar Salmonella. Trung tâm hợp tác tham khảo và nghiên cứu của WHO về vi khuẩn Salmonella. (tái bản lần thứ 9. ) 2007. 1–166.

22. Gilligan PH, Janda JM, Karmali MA, Miller MJ. Phòng thí nghiệm chẩn đoán bệnh tiêu chảy do vi khuẩn. Cumitech. 1992; 12A [Google Scholar]

23. Ethelberg S, Olsen KE, Gerner-Smidt P, và cộng sự. Tầm quan trọng của số lượng mẫu được gửi và các yếu tố liên quan đến bệnh nhân đối với chẩn đoán vi khuẩn trong phân. Vi sinh lâm sàng và nhiễm trùng. ấn phẩm chính thức của Hiệp hội Vi sinh lâm sàng và Bệnh truyền nhiễm Châu Âu. 2007; 13 (11). 1095–1099. [PubMed] [Google Scholar]

24. www. CDC. gov/ncezid/dfwed/pdfs/salmonella-annual-report-2011-508c. pdf.

25. Bouvet PJ, Jeanjean S. Đánh giá hai bộ dụng cụ latex màu, Xét nghiệm Wellcolex Color Salmonella và Xét nghiệm Wellcolex Color Shigella, đối với nhóm huyết thanh học của các loài Salmonella và Shigella. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 1992; 30 (8). 2184–2186. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

26. T khoa học. Thử nghiệm ngưng kết nhanh latex của Wellcolex Color Salmonella. Chèn gói. Được truy vấn vào ngày 22/11/2014, Có sẵn tại. http. //www. nhiệt khoa học. com/vi/product/wellcolex-color-salmonella-rapid-latex-agglutination-test-kit. html.

27. CLSI. M100-S24. Tiêu chuẩn thực hiện để kiểm tra tính mẫn cảm kháng sinh; . 2014 M100-S24. [Google Scholar]

28. Gonzalez-Lopez JJ, Piedra-Carrasco N, Salvador F, và cộng sự. ESBL-Sản xuất Salmonella enterica Serovar Typhi ở khách du lịch trở về từ Guatemala đến Tây Ban Nha. Bệnh truyền nhiễm mới nổi. 2014; 20 (11). 1918–1920. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

29. Irfan S, Khan E, Jabeen K, và những người khác. Các phân lập lâm sàng của Salmonella enterica serovar Agona sản xuất NDM-1 metallico-beta-lactamase. Báo cáo đầu tiên từ Pakistan. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2014 [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]<

30. Chiou CS, Alam M, Kuo JC và cộng sự. Kháng đa thuốc qua trung gian nhiễm sắc thể ở Salmonella enterica serovar Typhi. Các chất kháng khuẩn và hóa trị liệu. 2014 [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]<

31. Deng J, Fu L, Wang R, và cộng sự. So sánh MALDI-TOF MS, giải trình tự gen và Vitek 2 để xác định 73 chủng vi khuẩn gây bệnh đường ruột phân lập lâm sàng. Tạp chí bệnh lồng ngực. 2014; 6 (5). 539–544. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

32. Sparbier K, Weller U, Boogen C, và những người khác. Phát hiện nhanh Salmonella sp. bằng cách kết hợp canh thang tăng sinh chọn lọc và MALDI-TOF MS. Tạp chí vi sinh lâm sàng & bệnh truyền nhiễm châu Âu. ấn phẩm chính thức của Hiệp hội Vi sinh lâm sàng Châu Âu. 2012; 31 (5). 767–773. [PubMed] [Google Scholar]

33. Martiny D, Busson L, Wybo I, và những người khác. So sánh các hệ thống Microflex LT và Vitek MS để định danh vi khuẩn thường xuyên bằng thời gian ion hóa giải hấp phụ bằng laser có hỗ trợ ma trận của phép đo phổ khối bay. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2012; 50 (4). 1313–1325. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

34. Gerome P, Le Fleche P, Blouin Y, và cộng sự. Yersinia pseudotuberculosis ST42 (O. 1) Chủng bị xác định nhầm là Yersinia pestis bằng phân tích khối phổ. Thông báo về bộ gen. 2014; 2 (3) [Bài báo miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

35. Pugliese N, Circella E, Pazzani C, và những người khác. Xác nhận phương pháp PCR bán kết để phát hiện nhanh Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum. Tạp chí phương pháp vi sinh. 2011; 85 (1). 22–27. [PubMed] [Google Scholar]

36. Akiba M, Kusumoto M, Iwata T. Xác định nhanh các serovar Salmonella enterica, Typhimurium, Choleraesuis, Infantis, Hadar, Enteritidis, Dublin và Gallinarum, bằng PCR đa nhân. Tạp chí phương pháp vi sinh. 2011; 85 (1). 9–15. [PubMed] [Google Scholar]

37. Tankouo-Sandjong B, Sessitsch A, Liebana E, và những người khác. MLST-v, phân loại trình tự đa tiêu điểm dựa trên các gen độc lực, để phân loại phân tử của Salmonella enterica subsp. serovar enterica. Tạp chí phương pháp vi sinh. 2007; 69 (1). 23–36. [PubMed] [Google Scholar]

38. Duan R, Liang J, Shi G, et al. Phân tích tương đồng của các loài Yersinia gây bệnh Yersinia enterocolitica, Yersinia pseudotuberculosis, và Yersinia pestis dựa trên đánh máy trình tự đa điểm. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2014; 52 (1). 20–29. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

39. Mallik S, Virdi JS. Mối quan hệ di truyền giữa các chủng lâm sàng và không lâm sàng của Yersinia enterocolitica biovar 1A được tiết lộ bằng điện di enzyme đa điểm và gõ hạn chế đa điểm. BMC vi sinh. 2010; 10 . 158. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

40. Ruekit S, Wangchuk S, Dorji T, và những người khác. Đặc tính phân tử và phân loại bản sao dựa trên PCR của các chủng Shigella sonnei đa kháng thuốc phân lập từ một ổ dịch ở Thimphu, Bhutan. Ghi chú nghiên cứu BMC. 2014; 7 . 95. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

41. Voskresenskaya E, Savin C, Leclercq A, và những người khác. Định loại và phân nhóm các chủng giả lao Yersinia phân lập bằng phân tích đa hình chiều dài đoạn giới hạn sử dụng trình tự chèn. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2014; 52 (6). 1978–1989. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

42. Wang YW, Watanabe H, Phung DC, et al. Phân tích lặp lại song song số biến đa điểm để phân loại phân tử và phân tích phát sinh gen của Shigella flexneri. BMC vi sinh. 2009; 9 . 278. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

43. Deng X, Shariat N, Driebe EM, và cộng sự. Phân tích so sánh các phương pháp phân nhóm theo tiêu chuẩn giải trình tự toàn bộ bộ gen ở Salmonella enterica serotype Enteritidis. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2014 [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]<

44. McDonnell J, Dallman T, Atkin S, và cộng sự. Phân tích hồi cứu toàn bộ trình tự bộ gen so với dữ liệu đánh máy trong tương lai để cung cấp thêm thông tin cho cuộc điều tra dịch tễ học về sự bùng phát Shigella sonnei ở Anh. Dịch tễ học và nhiễm trùng. 2013; 141 (12). 2568–2575. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

45. Sangal V, Holt KE, Yuan J, và cộng sự. Phát sinh loài toàn cầu của các chủng Shigella sonnei từ các đa hình đơn nucleotide hạn chế (SNP) và phát triển sơ đồ phân loại SNP nhanh chóng và hiệu quả về chi phí để xác định chủng bằng phân tích nóng chảy có độ phân giải cao. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2013; 51 (1). 303–305. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

46. Khare R, Espy MJ, Cebelinski E, và những người khác. Đánh giá so sánh hai bảng ghép kênh thương mại để phát hiện mầm bệnh đường tiêu hóa bằng cách sử dụng mẫu phân lâm sàng. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2014; 52 (10). 3667–3673. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

47. Anderson NW, Buchan BW, Ledeboer NA. So sánh bảng điều khiển vi khuẩn đường ruột BD MAX với các phương pháp nuôi cấy thông thường để phát hiện Campylobacter, enterohemorrhagic Escherichia coli (O157), Salmonella và Shigella phân lập trong các mẫu phân được bảo quản. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2014; 52 (4). 1222–1224. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

48. Perry MD, Corden SA, Howe RA. Đánh giá Bảng điều khiển mầm bệnh đường tiêu hóa Luminex xTAG và Bảng điều khiển nhiễm trùng đường tiêu hóa Savyon Diagnostics để phát hiện mầm bệnh đường ruột trong các mẫu bệnh phẩm. Tạp chí vi sinh y học. 2014; 63 (Pt 11). 1419–1426. [PubMed] [Google Scholar]

49. Dunbar SA, Ritchie VB, Hoffmeyer MR, và cộng sự. Mảng huyền phù hạt multix Luminex((R)) để phát hiện và tạo kiểu huyết thanh của Salmonella spp. Các phương pháp trong sinh học phân tử. 2015; 1225 . 1–27. [PubMed] [Google Scholar]

50. Siah SP, Merif J, Kaur K, và những người khác. Cải thiện khả năng phát hiện mầm bệnh đường tiêu hóa bằng cách sử dụng các bảng khuếch đại và xử lý mẫu tổng quát. Bệnh lý. 2014; 46 (1). 53–59. [PubMed] [Google Scholar]

51. Wessels E, Rusman LG, van Bussel MJ, và cộng sự. Giá trị gia tăng của xét nghiệm Multiplex Luminex Gastrointestinal Pathogen Panel (xTAG(R) GPP) trong chẩn đoán viêm dạ dày ruột truyền nhiễm. Vi sinh lâm sàng và nhiễm trùng. ấn phẩm chính thức của Hiệp hội Vi sinh lâm sàng và Bệnh truyền nhiễm Châu Âu. 2014; 20 (3). O182–O187. [PubMed] [Google Scholar]

52. Navidad JF, Griswold DJ, Gradus MS, v.v. Đánh giá các thuốc thử đặc hiệu phân tích mầm bệnh đường tiêu hóa Luminex xTAG để phát hiện thông lượng cao, đồng thời vi khuẩn, vi rút và ký sinh trùng có tầm quan trọng về lâm sàng và sức khỏe cộng đồng. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2013; 51 (9). 3018–3024. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

53. Pierce SE, Bell RL, Hellberg RS, v.v. Phát hiện và Định danh Salmonella enterica, Escherichia coli và Shigella spp. thông qua phép đo khối phổ ion hóa PCR-electrospray. cách ly xét nghiệm và phân tích mẫu thực phẩm. Vi sinh ứng dụng và môi trường. 2012; 78 (23). 8403–8411. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

54. Shigella. trang web CDC. http. //wwwcdcgov/shigella/ và http. //wwwcdcgov/pulsenet/pathogens/shigellahtml.

55. Papasian CJ, Enna-Kifer S, Garrison B. Nhiễm trùng đường tiết niệu Shigella sonnei có triệu chứng. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 1995; 33 (8). 2222–2223. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

56. Appannanavar SB, Goyal K, Garg R, và cộng sự. Shigellemia ở bệnh nhân sau ghép thận. Một báo cáo tình hình và sự cân nhắc tài liệu. Nhật ký lây nhiễm ở các nước đang phát triển. 2014; 8 (2). 237–239. [PubMed] [Google Scholar]

57. Markham KB, Backes C, Jr. , Samuel P. Vi khuẩn huyết và nhiễm trùng trong tử cung với Shigella sonnei ở phụ nữ mang thai bị AIDS. Lưu trữ phụ khoa và sản khoa. 2012; 286 (3). 799–801. [PubMed] [Google Scholar]

58. Shigella và Escherichia coli xâm lấn đường ruột. Trong. Acheson DWK, Keusch GT, biên tập viên; . Nhiễm trùng đường tiêu hóa. New York, NY. Quạ báo chí; . trang. 763–784. [Google Scholar]

59. Kotloff KL, Winickoff JP, Ivanoff B, và những người khác. Gánh nặng nhiễm Shigella toàn cầu. ý nghĩa đối với việc phát triển vắc-xin và thực hiện các chiến lược kiểm soát. Bản tin của Tổ chức Y tế Thế giới. 1999; 77 (8). 651–666. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

60. Bardhan P, Faruque AS, Naheed A, và cộng sự. Giảm tử vong liên quan đến bệnh shigella mà không có Shigella spp. -các can thiệp cụ thể, Châu Á. Bệnh truyền nhiễm mới nổi. 2010; 16 (11). 1718–1723. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

61. Van de Verg LL, Venkatesan MM. xã luận bình luận. vắc-xin Shigella chống lại các kiểu huyết thanh phổ biến. Bệnh truyền nhiễm lâm sàng. một ấn phẩm chính thức của Hiệp hội bệnh truyền nhiễm Hoa Kỳ. 2014; 59 (7). 942–943. [PubMed] [Google Scholar]

62. Scallan E, Hoekstra RM, Angulo FJ, và những người khác. Bệnh do thực phẩm mắc phải ở Hoa Kỳ--các mầm bệnh chính. Bệnh truyền nhiễm mới nổi. 2011; 17 (1). 7–15. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

63. DuPont HL, Levine MM, Hornick RB, và những người khác. Kích thước vi khuẩn trong bệnh shigellosis và ý nghĩa đối với phương thức lây truyền dự kiến. Tạp chí bệnh truyền nhiễm. 1989; 159 (6). 1126–1128. [PubMed] [Google Scholar]

64. Shigella sonnei bùng phát ở nam quan hệ tình dục đồng giới--San Francisco, California, 2000–2001. Báo cáo hàng tuần về tỷ lệ mắc bệnh và tử vong của MMWR. 2001; 50 (42). 922–926. [PubMed] [Google Scholar]

65. Các đợt bùng phát Shigella sonnei rhamnose âm tính liên quan đến dịch vụ chăm sóc ban ngày--sáu bang, tháng 6 năm 2001–tháng 3 năm 2003. Báo cáo hàng tuần về tỷ lệ mắc bệnh và tử vong của MMWR. 2004; 53 (3). 60–63. [PubMed] [Google Scholar]

66. Bùng phát bệnh viêm dạ dày ruột do Shigella sonnei đa kháng thuốc liên quan đến các trung tâm chăm sóc ban ngày--Kansas, Kentucky và Missouri, 2005. Báo cáo hàng tuần về tỷ lệ mắc bệnh và tử vong của MMWR. 2006; 55 (39). 1068–1071. [PubMed] [Google Scholar]

67. Arvelo W, Hinkle CJ, Nguyen TA, et al. Các yếu tố nguy cơ lây truyền và điều trị bệnh shigella ở trẻ em trong đợt bùng phát Shigella sonnei đa kháng thuốc tại trung tâm chăm sóc ban ngày. ý nghĩa đối với việc quản lý bùng phát bệnh shigella ở trẻ em. Tạp chí bệnh truyền nhiễm Nhi khoa. 2009; 28 (11). 976–980. [PubMed] [Google Scholar]

68. Daskalakis DC, Blaser MJ. Một cơn bão hoàn hảo khác. Shigella, nam quan hệ tình dục đồng giới và HIV. Bệnh truyền nhiễm lâm sàng. một ấn phẩm chính thức của Hiệp hội bệnh truyền nhiễm Hoa Kỳ. 2007; 44 (3). 335–337. [PubMed] [Google Scholar]

69. Khan WA, Griffiths JK, Bennish ML. Các biểu hiện đường tiêu hóa và ngoài ruột của bệnh shigella ở trẻ em ở vùng có cả 4 loài Shigella lưu hành. PloS one. 2013; 8 (5). e64097. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

70. Tauxe RV, Puhr ND, Wells JG, và những người khác. Kháng kháng sinh của các chủng Shigella phân lập tại Mỹ. tầm quan trọng của du khách quốc tế. Tạp chí bệnh truyền nhiễm. 1990; 162 (5). 1107–1111. [PubMed] [Google Scholar]

71. von Seidlein L, Kim DR, Ali M, và cộng sự. Một nghiên cứu đa trung tâm về bệnh tiêu chảy do Shigella ở sáu quốc gia châu Á. gánh nặng bệnh tật, biểu hiện lâm sàng và vi sinh. Thuốc PLoS. 2006; 3 (9). e353. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

72. van den Beld MJ, Reubsaet FA. Phân biệt giữa Shigella, Escherichia coli xâm lấn ruột (EIEC) và Escherichia coli không xâm lấn. Tạp chí vi sinh lâm sàng & bệnh truyền nhiễm châu Âu. ấn phẩm chính thức của Hiệp hội Vi sinh lâm sàng Châu Âu. 2012; 31 (6). 899–904. [PubMed] [Google Scholar]

73. Huys G, Cnockaert M, Janda JM, và cộng sự. Escherichia albertii sp. tháng mười một. , một loài gây bệnh tiêu chảy được phân lập từ mẫu phân của trẻ em Bangladesh. Tạp chí quốc tế về vi sinh học có hệ thống và tiến hóa. 2003; 53 (Pt 3). 807–810. [PubMed] [Google Scholar]

74. Hyma KE, Lacher DW, Nelson AM, và những người khác. Di truyền học tiến hóa của một loài Escherichia gây bệnh mới. Escherichia albertii và các chủng Shigella boydii liên quan. Tạp chí vi khuẩn học. 2005; 187 (2). 619–628. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

75. Thắng WC, Jr. , Allen SD, Janda WM, Koneman EW, Procop GW, Schreckenberger PC, Woods GL. Atlas màu của Koneman và sách giáo khoa vi sinh chẩn đoán. tái bản lần thứ 6. Baltimore, MD. Lippincott, Williams, & Wilkins; . Enterobacteriaceae; . 211–302. [Google Scholar]

76. Lindberg AA, Karnell A, Weintraub A. Lipopolysacarit của vi khuẩn Shigella như một yếu tố độc lực. Nhận xét về bệnh truyền nhiễm. 1991; 13 (Bổ sung 4). S279–S284. [PubMed] [Google Scholar]

77. Porter CK, Thura N, Ranallo RT, và cộng sự. Mô hình thách thức con người Shigella. Dịch tễ học và nhiễm trùng. 2013; 141 (2). 223–232. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

78. Campilongo R, Di Martino ML, Marcocci L, và cộng sự. Cấu hình phân tử và chức năng của hàm lượng polyamine trong E xâm lấn ruột. coli. nhìn vào khoảng cách giữa commensal E. coli và Shigella có hại. PloS one. 2014; 9 (9). e106589. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

79. Carroll KC, Borek AP, Burger C, v.v. Đánh giá hệ thống vi sinh tự động BD Phoenix để xác định và xét nghiệm độ nhạy cảm với kháng sinh của tụ cầu và cầu khuẩn ruột. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2006; 44 (6). 2072–2077. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

80. Aldridge KE, Gardner BB, Clark SJ, và những người khác. So sánh micro-ID, API 20E và các hệ thống phương tiện thông thường trong việc xác định Enterobacteriaceae. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 1978; 7 (6). 507–513. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

81. O'Hara CM, Rhoden DL, Miller JM. Đánh giá lại hệ thống nhận dạng API 20E so với các chất sinh hóa thông thường để nhận dạng các thành viên của họ Enterobacteriaceae. một cái nhìn mới về một sản phẩm cũ. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 1992; 30 (1). 123–125. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

82. Peele D, Bradfield J, Pryor W, và cộng sự. So sánh nhận dạng vi khuẩn gram âm nguồn gốc từ người và động vật bằng API 20E và hệ thống E/NF tinh thể. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 1997; 35 (1). 213–216. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

83. Robinson A, McCarter YS, Tetreault J. So sánh hệ thống Crystal Enteric/Nonfermenter, hệ thống API 20E và hệ thống Vitek AutoMicrobic để xác định trực khuẩn gram âm. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 1995; 33 (2). 364–370. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

84. Khot PD, Fisher MA. Phương pháp mới để phân biệt các loài Shigella và Escherichia coli bằng thời gian ion hóa giải hấp laser có hỗ trợ ma trận của phép đo phổ khối bay. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2013; 51 (11). 3711–3716. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

85. Gould LH, Bopp C, Strockbine N, và cộng sự. Khuyến cáo chẩn đoán nhiễm khuẩn Escherichia coli sinh độc tố shiga bởi các phòng xét nghiệm lâm sàng. Đề xuất và báo cáo MMWR. Báo cáo hàng tuần về tỷ lệ mắc bệnh và tử vong Khuyến nghị và báo cáo / Trung tâm kiểm soát dịch bệnh. 2009; 58 (RR-12). 1–14. [PubMed] [Google Scholar]

86. Gavin PJ, Peterson LR, Pasquariello AC, và cộng sự. Đánh giá hiệu suất và tác động lâm sàng tiềm tàng của xét nghiệm vi đĩa ProSpecT Shiga độc tố Escherichia coli để phát hiện vi khuẩn E sinh độc tố Shiga. coli trong mẫu phân. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 2004; 42 (4). 1652–1656. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

87. Mackenzie AM, Lebel P, Orrbine E, và cộng sự. Độ nhạy và độ đặc hiệu của prime E. coli O157 và các xét nghiệm miễn dịch enzyme EHEC hàng đầu để chẩn đoán nhiễm Escherichia coli sinh ra verotxin (độc tố giống Shiga). Các nhà điều tra Nghiên cứu SYNSORB Pk. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 1998; 36 (6). 1608–1611. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

88. Anh ấy X, Patfield S, Hnasko R, và những người khác. Xét nghiệm miễn dịch dựa trên kháng thể đa dòng phát hiện bảy loại phụ của độc tố Shiga 2 do Escherichia coli sản xuất trong mẫu người và mẫu môi trường. PloS one. 2013; 8 (10). e76368. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

89. Urdahl AM, Solheim HT, Vold L, và những người khác. Gen mã hóa độc tố Shiga (gen stx) trong mẫu phân người. APMIS. acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica. 2013; 121 (3). 202–210. [PubMed] [Google Scholar]

90. Ashkenazi S, Levy I, Kazaronovski V, và những người khác. Tăng khả năng kháng kháng sinh của các chủng Shigella phân lập. Tạp chí hóa trị kháng sinh. 2003; 51 (2). 427–429. [PubMed] [Google Scholar]

91. Khatun F, Faruque AS, Koeck JL, và những người khác. Thay đổi phân bố loài và mô hình nhạy cảm với kháng sinh của Shigella trong khoảng thời gian 29 năm (1980–2008) Dịch tễ học và nhiễm trùng. 2011; 139 (3). 446–452. [PubMed] [Google Scholar]

92. Taneja N, Mewara A, Kumar A, và những người khác. Shigella flexneri kháng Cephalosporin hơn 9 năm (2001-09) ở Ấn Độ. Tạp chí hóa trị kháng sinh. 2012; 67 (6). 1347–1353. [PubMed] [Google Scholar]

93. Vinh H, Nhu NT, Nga TV, et al. Bức tranh thay đổi về bệnh shigella ở miền Nam Việt Nam. thay đổi sự thống trị của loài, tính nhạy cảm với kháng sinh và biểu hiện lâm sàng. Bệnh truyền nhiễm BMC. 2009; 9 . 204. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

94. Zhang W, Luo Y, Li J, et al. Phổ biến rộng rãi các chủng phân lập Shigella đa kháng thuốc ở Trung Quốc. Tạp chí hóa trị kháng sinh. 2011; 66 (11). 2527–2535. [PubMed] [Google Scholar]

95. Ghosh S, Pazhani GP, Chowdhury G, và những người khác. Đặc điểm di truyền và sự thay đổi tính kháng thuốc của Shigella spp. phân lập từ bệnh nhân tiêu chảy nhập viện ở Kolkata, Ấn Độ. Tạp chí vi sinh y học. 2011; 60 (Pt 10). 1460–1466. [PubMed] [Google Scholar]

96. Jain S, Sharma M, Gupta R, và những người khác. Shigella flexneri đa kháng thuốc. một trường hợp nhiễm trùng máu hiếm gặp ở trẻ sơ sinh. Tạp chí nghiên cứu lâm sàng và chẩn đoán. JCDR. 2014; 8 (6). DD03–DD04. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

97. Azmi IJ, Khajanchi BK, Akter F, và những người khác. Cơ chế kháng fluoroquinolone của Shigella flexneri phân lập ở Bangladesh. PloS one. 2014; 9 (7). e102533. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

98. Philipon A, Sansonetti PJ. Cách Shigella thao túng hệ thống miễn dịch thích ứng và bẩm sinh đường ruột của vật chủ. một hộp công cụ để tồn tại? . Immunology and cell biology. 2007; 85 (2). 119–129. [PubMed] [Google Scholar]

99. Schroeder GN, Hilbi H. Sinh bệnh học phân tử của Shigella spp. kiểm soát tín hiệu, sự xâm lấn và cái chết của tế bào chủ bằng cách bài tiết loại III. Đánh giá vi sinh lâm sàng. 2008; 21 (1). 134–156. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

100. Ogawa M, Handa Y, Ashida H, và cộng sự. Tính linh hoạt của Shigella effector. Đánh giá tự nhiên Vi sinh. 2008; 6 (1). 11–16. [PubMed] [Google Scholar]

101. Barry EM, Pasetti MF, Sztein MB, và những người khác. Tiến bộ và cạm bẫy trong nghiên cứu vắc-xin Shigella. Nature đánh giá Khoa Tiêu hóa & Gan mật. 2013; 10 (4). 245–255. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

102. Herold S, Karch H, Schmidt H. Thể thực khuẩn mã hóa độc tố Shiga--bộ gen chuyển động. Tạp chí quốc tế về vi sinh y học. IJMM. 2004; 294 (2–3). 115–121. [PubMed] [Google Scholar]

103. Donohue-Rolfe A, Acheson DW, Keusch GT. độc tố Shiga. thanh lọc, cấu trúc và chức năng. Nhận xét về bệnh truyền nhiễm. 1991; 13 (Bổ sung 4). S293–S297. [PubMed] [Google Scholar]

104. Kim YJ, Yeo SG, Park JH, và những người khác. Phát triển vắc-xin Shigella. mô hình động vật triển vọng và tình trạng hiện tại. Công nghệ sinh học dược phẩm hiện nay. 2013; 14 (10). 903–912. [PubMed] [Google Scholar]

105. Bottone EJ. Yersinia enterocolitica. sự lôi cuốn vẫn tiếp tục. Đánh giá vi sinh lâm sàng. 1997; 10 (2). 257–276. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

106. Yersinia. trang web CDC. http. //wwwcdcgov/nczved/divisions/dfbmd/diseases/yersinia/

107. Bìa TL, Aber RC. Yersinia enterocolitica. Tạp chí y học New England. 1989; 321 (1). 16–24. [PubMed] [Google Scholar]

108. Foberg U, Fryden A, Kihlstrom E, và cộng sự. Nhiễm khuẩn huyết Yersinia enterocolitica. khía cạnh lâm sàng và vi sinh. Tạp chí bệnh truyền nhiễm Scandinavia. 1986; 18 (4). 269–279. [PubMed] [Google Scholar]

109. Giamarellou H, Antoniadou A, Kanavos K, và cộng sự. Yersinia enterocolitica viêm nội tâm mạc. báo cáo trường hợp và xem xét tài liệu. Tạp chí vi sinh lâm sàng & bệnh truyền nhiễm châu Âu. ấn phẩm chính thức của Hiệp hội Vi sinh lâm sàng Châu Âu. 1995; 14 (2). 126–130. [PubMed] [Google Scholar]

110. van der Heijden IM, Res PC, Wilbrink B, và những người khác. Yersinia enterocolitica. nguyên nhân viêm đa khớp mãn tính. Bệnh truyền nhiễm lâm sàng. một ấn phẩm chính thức của Hiệp hội bệnh truyền nhiễm Hoa Kỳ. 1997; 25 (4). 831–837. [PubMed] [Google Scholar]

111. Adamkiewicz TV, Berkovitch M, Krishnan C, và cộng sự. Nhiễm trùng do Yersinia enterocolitica ở hàng loạt bệnh nhân mắc bệnh beta-thalassemia. tỷ lệ mắc bệnh và các yếu tố ảnh hưởng. Bệnh truyền nhiễm lâm sàng. một ấn phẩm chính thức của Hiệp hội bệnh truyền nhiễm Hoa Kỳ. 1998; 27 (6). 1362–1366. [PubMed] [Google Scholar]

112. Yersinia enterocolitica viêm dạ dày ruột ở trẻ sơ sinh tiếp xúc với chitterling--Chicago, Illinois, 2002. Báo cáo hàng tuần về tỷ lệ mắc bệnh và tử vong của MMWR. 2003; 52 (40). 956–958. [PubMed] [Google Scholar]

113. Abdel-Haq NM, Asmar BI, Abuhammour WM, và cộng sự. Nhiễm Yersinia enterocolitica ở trẻ em. Tạp chí bệnh truyền nhiễm Nhi khoa. 2000; 19 (10). 954–958. [PubMed] [Google Scholar]

114. Fredriksson-Ahomaa M, Stolle A, Korkeala H. Dịch tễ học phân tử của nhiễm trùng Yersinia enterocolitica. FEMS miễn dịch học và vi sinh y học. 2006; 47 (3). 315–329. [PubMed] [Google Scholar]

115. Jones TF. Từ lợn đến núm vú giả. sự bùng phát bệnh yersiniosis liên quan đến tiếng kêu ở trẻ sơ sinh da đen. Bệnh truyền nhiễm mới nổi. 2003; 9 (8). 1007–1009. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

116. Lee LA, Gerber AR, Lonsway DR, và cộng sự. Yersinia enterocolitica O. 3 bệnh nhiễm trùng ở trẻ sơ sinh và trẻ nhỏ, liên quan đến việc chuẩn bị thức ăn cho trẻ trong gia đình. Tạp chí y học New England. 1990; 322 (14). 984–987. [PubMed] [Google Scholar]

117. Lee LA, Taylor J, Carter GP, và cộng sự. Yersinia enterocolitica O. 3. một nguyên nhân mới nổi của bệnh viêm dạ dày ruột ở trẻ em tại Hoa Kỳ. Nhóm nghiên cứu hợp tác Yersinia enterocolitica. Tạp chí bệnh truyền nhiễm. 1991; 163 (3). 660–663. [PubMed] [Google Scholar]

118. Wagner SJ, Friedman LI, Dodd RY. Nhiễm khuẩn huyết do truyền máu. Đánh giá vi sinh lâm sàng. 1994; 7 (3). 290–302. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

119. Tertti R, Vuento R, Mikkola P, và cộng sự. Biểu hiện lâm sàng nhiễm giả lao Yersinia ở trẻ em. Tạp chí vi sinh lâm sàng & bệnh truyền nhiễm châu Âu. ấn phẩm chính thức của Hiệp hội Vi sinh lâm sàng Châu Âu. 1989; 8 (7). 587–591. [PubMed] [Google Scholar]

120. Crchova V, Grondin C. [Nhiễm trùng tiết niệu do Yersinia pseudotuberculosis] La Vie Medicale au Canada francais. 1973; 2 (1). 3–5. [PubMed] [Google Scholar]

121. Ljungberg P, Valtonen M, Harjola VP, và những người khác. Báo cáo về 4 trường hợp nhiễm trùng huyết do Yersinia pseudotuberculosis và tổng quan tài liệu. Tạp chí vi sinh lâm sàng & bệnh truyền nhiễm châu Âu. ấn phẩm chính thức của Hiệp hội Vi sinh lâm sàng Châu Âu. 1995; 14 (9). 804–810. [PubMed] [Google Scholar]

122. Naiel B, Raul R. Viêm tuyến tiền liệt mãn tính do Yersinia pseudotuberculosis. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 1998; 36 (3). 856. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

123. Nuorti JP, Niskanen T, Hallanvuo S, và cộng sự. Sự bùng phát lan rộng của Yersinia pseudotuberculosis O. 3 nhiễm trùng từ rau diếp băng. Tạp chí bệnh truyền nhiễm. 2004; 189 (5). 766–774. [PubMed] [Google Scholar]

124. Jalava K, Hakkinen M, Valkonen M, và những người khác. Bùng phát bệnh đường tiêu hóa và ban đỏ nốt do cà rốt nạo nhiễm vi khuẩn giả lao Yersinia. Tạp chí bệnh truyền nhiễm. 2006; 194 (9). 1209–1216. [PubMed] [Google Scholar]

125. Reuter S, Connor TR, Barquist L, và những người khác. Sự tiến hóa độc lập song song của khả năng gây bệnh trong chi Yersinia. Kỷ yếu của Viện Hàn lâm Khoa học Quốc gia Hoa Kỳ. 2014; 111 (18). 6768–6773. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

126. Archer JR, Schell RF, Pennell DR, v.v. Xác định Yersinia spp. với hệ thống API 20E. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 1987; 25 (12). 2398–2399. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

127. Sharma NK, Doyle PW, Gerbasi SA, và cộng sự. Định danh loài Yersinia bằng API 20E. Tạp chí vi sinh lâm sàng. 1990; 28 (6). 1443–1444. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

128. Wunderink HF, Oostvogel PM, Frenay IH, và cộng sự. Khó khăn trong chẩn đoán viêm hồi tràng giai đoạn cuối do giả lao Yersinia. Tạp chí vi sinh lâm sàng & bệnh truyền nhiễm châu Âu. ấn phẩm chính thức của Hiệp hội Vi sinh lâm sàng Châu Âu. 2014; 33 (2). 197–200. [PubMed] [Google Scholar]

129. Singhal N, Kumar M, Virdi JS. Phân tích phân tử gen beta-lactamase để hiểu biểu hiện khác biệt của chúng trong các chủng Yersinia enterocolitica biotype 1A. Báo cáo khoa học. 2014; 4 . 5270. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

130. Batzilla J, Heesemann J, Rakin A. Khả năng gây bệnh của Yersinia enterocolitica 1A. Tạp chí quốc tế về vi sinh y tế. IJMM. 2011; 301 (7). 556–561. [PubMed] [Google Scholar]

131. Rakin A, Schneider L, Podladchikova O. Đói sắt. các hệ thống nhặt rác sắt siderophore thay thế ở Yersinia độc lực cao. Ranh giới vi sinh tế bào và nhiễm trùng. 2012; 2 . 151. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

132. Capilla S, Ruiz J, Goni P, và những người khác. Đặc điểm của các cơ chế phân tử kháng quinolone ở Yersinia enterocolitica O. 3 phân lập lâm sàng. Tạp chí hóa trị kháng sinh. 2004; 53 (6). 1068–1071. [PubMed] [Google Scholar]

133. Pham JN, Bell SM, Martin L, et al. Beta-lactamase và tính mẫn cảm với kháng sinh beta-lactam của Yersinia enterocolitica. Tạp chí hóa trị kháng sinh. 2000; 46 (6). 951–957. [PubMed] [Google Scholar]

134. Porter CK, Choi D, Cash B, và những người khác. Nguy cơ đặc hiệu của mầm bệnh đối với rối loạn tiêu hóa mãn tính sau các nguyên nhân vi khuẩn gây bệnh từ thực phẩm. Khoa tiêu hóa BMC. 2013; 13 . 46. [Bài viết miễn phí của PMC] [PubMed] [Google Scholar]

135. Dizdar V, Gilja OH, Hausken T. Tăng nhạy cảm nội tạng trong hội chứng ruột kích thích sau nhiễm trùng do Giardia và chứng khó tiêu chức năng. Ảnh hưởng của chất đối kháng 5HT3 ondansetron. Thần kinh tiêu hóa và vận động. tạp chí chính thức của Hiệp hội Vận động Tiêu hóa Châu Âu. 2007; 19 (12). 977–982. [PubMed] [Google Scholar]

136. Falth-Magnusson K, Franzen L, Jansson G, và cộng sự. Lịch sử nuôi dưỡng trẻ sơ sinh cho thấy sự khác biệt rõ rệt giữa trẻ celiac Thụy Điển và trẻ tham chiếu. Dị ứng và miễn dịch ở trẻ em. ấn phẩm chính thức của Hiệp hội Dị ứng và Miễn dịch Nhi khoa Châu Âu.

Tác nhân rủi ro Nhóm 2 là gì?

Các sinh vật nhóm 4 có nguy cơ là gì?

Ví dụ về tác nhân nhóm rủi ro 2 sẽ yêu cầu ít nhất môi trường phòng thí nghiệm BSL 2 An toàn sinh học cấp độ 2 là gì?

Các nhóm rủi ro được phân loại như thế nào?